57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2105 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  51.5 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  34.68 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  43.32 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  36.78 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  39.58 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  36.97 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  36.97 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  36.97 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  44.07 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  40.53 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  32.63 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  39.04 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  35.81 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  39.23 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  30.74 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  36.51 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  30.61 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  35.64 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  31.06 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  32.56 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.32 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  42.22 
 
 		 195 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  36.55 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  41.38 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  40.13 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  34.78 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  37.3 
 
 		 283 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  39.47 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  32.89 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.02 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  24.19 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  31.5 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  32.47 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  27.46 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  33.68 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  36.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  25.13 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  26.72 
 
 		 344 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  29.49 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  29.32 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 		 356 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  30.25 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  30.25 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  29.27 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  27.64 
 
 		 354 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  26.83 
 
 		 353 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>