66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0346 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  93.47 
 
 		 245 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  93.06 
 
 		 245 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  84.15 
 
 		 246 aa  420  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  75.1 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  74.29 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  74.29 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  74.29 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  72.58 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  59.75 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  54.58 
 
 		 259 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  55.82 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  52.26 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  54.25 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  52.48 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  39.58 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  35.42 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  34.48 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  44.79 
 
 		 200 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  44.79 
 
 		 200 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  37.93 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  35.02 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  35.05 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  46.62 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  46.62 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  38.1 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  43.14 
 
 		 195 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  28.11 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  34.11 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  42.19 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  30.12 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  37.1 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.28 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  34.18 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  29.94 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.96 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  27.17 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  29.48 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  21.74 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  29.49 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  29.87 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  30.72 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  26.47 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  31.1 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  27.06 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  29.57 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  29.46 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  29.13 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  27.52 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  27.54 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  26.67 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  29.33 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  28.25 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  29.33 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  26.7 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  26.56 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  26.56 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  30.83 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  26.37 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  26.37 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  28.43 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  24.44 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>