57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0302 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  94.36 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  76.14 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  76.14 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  77.39 
 
 		 271 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  75.19 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  75.76 
 
 		 272 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  76.45 
 
 		 272 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  58.69 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  55.56 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  51.31 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  51.31 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  57.33 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  49.24 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  50.95 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  57.51 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  45.42 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  51.15 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  47.88 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  38.81 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  43.21 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  43.21 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  39.39 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  37.25 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  29.56 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  33.12 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  28.88 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  31.36 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  28.45 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  28.36 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  28.77 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  25.46 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  27.16 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  28.85 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  27.56 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  27.78 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  27.22 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  33.12 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.71 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  27.51 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  27.51 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  33.12 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  26.92 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  27.78 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  25.5 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  30.87 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  30.28 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  30.28 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  31.03 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>