54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00799 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  67.01 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  67.01 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  58.88 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  50.45 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  55.5 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  53.77 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  54.45 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  39.39 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  39.39 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  47.97 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  42.28 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  46.38 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  43.14 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  39.29 
 
 		 247 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  45.6 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  44 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  38.38 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  44.09 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  44.07 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  42.22 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  33.51 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  34.54 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  43.75 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  31.76 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  37.74 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  35.38 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  39.8 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  34.29 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  39.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  49.28 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  27.96 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  38.94 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  36.29 
 
 		 265 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  41.12 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  43.75 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  23.14 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  34.78 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  38.84 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  36.54 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  32.4 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  30 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  32.43 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  37.11 
 
 		 275 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  31.53 
 
 		 267 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>