66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1325 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  50.39 
 
 
264 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  49.42 
 
 
271 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  50.57 
 
 
272 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  50.57 
 
 
272 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  47.67 
 
 
267 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  52.12 
 
 
269 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  48.26 
 
 
267 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  44.91 
 
 
275 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  45.91 
 
 
266 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  50 
 
 
277 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  47.21 
 
 
278 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  50.19 
 
 
273 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  46.22 
 
 
271 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  46.22 
 
 
271 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  49.43 
 
 
272 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  49.43 
 
 
272 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  48.23 
 
 
267 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  47.15 
 
 
266 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  44.26 
 
 
294 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  40.25 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  38.61 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  39.88 
 
 
259 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  39.88 
 
 
259 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  29.32 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  27.17 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  31.63 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  31.22 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  32.3 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  27.27 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  31.68 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  31.68 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.92 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  27.24 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  29.03 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  31.14 
 
 
245 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  28.35 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  30.72 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  29.35 
 
 
242 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  32.06 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.13 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  31.18 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  27.86 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  28.46 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  32.43 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  35.83 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  30.47 
 
 
246 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  34.07 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  28.3 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  28.8 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  36.29 
 
 
195 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  31.35 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  28.31 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  29.12 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  25.13 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  29.8 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  29.68 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  27.93 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  26.99 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  31.47 
 
 
200 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  31.47 
 
 
200 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  28.38 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  31.65 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  27.84 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1920  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  39.39 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0234553  hitchhiker  0.0031791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>