58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2754 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  60.16 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  57.03 
 
 		 267 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  58.57 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  58.57 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  57.53 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  59.76 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  56.65 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  53.21 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  57.09 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  50.39 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  54.34 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  57.53 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  57.14 
 
 		 272 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  50.75 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  50.75 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  50.58 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  52.11 
 
 		 266 aa  234  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  47.69 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  44.44 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  42.59 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  38.68 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  40.85 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  41.92 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  41.92 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  30.41 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  28.73 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  29.29 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  33.58 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  28.18 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  30.54 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  30.48 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  26.8 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  30.86 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  26.95 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  25.56 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  27.1 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  27.1 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  33.85 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  25.81 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  24.85 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  24.85 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  24.85 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  25.97 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  31.54 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  29.8 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  35.06 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  24.24 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  35.06 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  30.32 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  33.77 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  28.14 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  25.32 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  27.15 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  36.48 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>