46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1370 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  67.55 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  56.98 
 
 		 275 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  57.36 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  55.47 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  55.47 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  53.51 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  52.06 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  52.06 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  54.37 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  51.71 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  54.72 
 
 		 272 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  54.72 
 
 		 272 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  49.62 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  50.95 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  54.94 
 
 		 269 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  50.19 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  47.21 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  43.89 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  42.47 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  38.11 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  42.13 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  41.83 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  38.64 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  38.64 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  34.23 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  30.93 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  32.21 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  32.21 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  30.6 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  30.06 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.74 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  34.43 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  28.49 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  28.65 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  29.46 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  33.7 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  31.01 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  28.39 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  29.09 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  26.72 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  27.34 
 
 		 238 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  26.02 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  25.78 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  25.2 
 
 		 244 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>