56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02882 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  508  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  61.96 
 
 
259 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  60.7 
 
 
259 aa  300  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  57.14 
 
 
282 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  42.31 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  40.62 
 
 
271 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  40.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  43.22 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  43.22 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  45.69 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  41.78 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  40.25 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  42.33 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  41.83 
 
 
278 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  36.98 
 
 
275 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  39.92 
 
 
266 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  40.87 
 
 
272 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  40.09 
 
 
272 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  40.21 
 
 
266 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  42.93 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  35.34 
 
 
294 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  37.57 
 
 
264 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  43.62 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  33.55 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  40.23 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  41.38 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  33.88 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  29.82 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  32.24 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  37.93 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  30.99 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  30.99 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  32.65 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  29.82 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  30.32 
 
 
238 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  32.56 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  30.23 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  31.78 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  29.14 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  26.83 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  30.39 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  27.01 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  27.08 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  28.99 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  36.49 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  29.33 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  27.86 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  29.32 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3468  beta-ketoacyl synthase  30.2 
 
 
415 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.749166  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  32.69 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1492  Beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 
423 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.447881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>