68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3674 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  99.59 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  93.06 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  83.74 
 
 		 246 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  74.29 
 
 		 244 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  73.47 
 
 		 244 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  72.58 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  73.47 
 
 		 244 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  73.47 
 
 		 244 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  58.23 
 
 		 227 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  52.87 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  54.4 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  55.33 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  52.46 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  53.5 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  34.48 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  40.41 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  37.07 
 
 		 226 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  35.64 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  40.82 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  40.82 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  34.52 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  46.62 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  46.62 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  38.89 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  35.19 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  42.19 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  31.79 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  37.01 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  32.6 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.67 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  27.13 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.57 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  27.09 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  23.15 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  30.18 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  31.14 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  30.43 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  28.88 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  30.97 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  31.93 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  29.09 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  27.59 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  28.36 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  27.54 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  26.47 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  26.9 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  29.09 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  29.13 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  27.12 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  27.12 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  29.61 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  26.02 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  26.2 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  26.2 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  24.41 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  25.84 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  27.52 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  28.43 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  32.58 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  24.5 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  29.23 
 
 		 354 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>