49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2153 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  92.99 
 
 		 271 aa  500  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  87.87 
 
 		 272 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  87.5 
 
 		 272 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  79.69 
 
 		 273 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  76.25 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  76.14 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  59.46 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  58.3 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  59.85 
 
 		 277 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  55.47 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  51.87 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  51.87 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  50 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  58.23 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  53.26 
 
 		 266 aa  231  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  47.1 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  50.57 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  39.57 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  42.8 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  41.32 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  40.08 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  34.58 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  32.57 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  31.55 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  29.03 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  26.36 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  28.48 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  29.57 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  31.41 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  26.56 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  30.83 
 
 		 195 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  26.94 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.01 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  23.35 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  35.42 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  26.55 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  25.67 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  31.25 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  24.56 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  29.15 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  27.08 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  25.13 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>