72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004062 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  51.5 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  34.58 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  36.2 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  33.06 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  32.64 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  35.26 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  37.56 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  34.52 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  34.52 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  35.05 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  31.4 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  34.2 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  32.4 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  32.79 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  36.78 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  33.85 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  33.48 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  32.39 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  38.46 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  32.39 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  35.52 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  37.67 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  27.97 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  30.25 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  34.66 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  29.11 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  27.85 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  33.51 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.8 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  35.37 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  30.48 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  29.73 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  35 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  36.72 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  35.66 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  29.52 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  28.8 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  25.81 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  29.35 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  27.18 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  32.24 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  27.78 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  27.56 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  26.38 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  26.9 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  30.46 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  32.79 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  31.67 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  26.88 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  26.44 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  26.44 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  23.77 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  36.78 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  26.32 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  26.72 
 
 		 354 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  27.22 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  35.16 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  30.08 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  24.56 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  24.56 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  26.35 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  23.78 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  29.01 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  30.69 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  23.78 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  28.57 
 
 		 356 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>