21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2004 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  721    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  42.53 
 
 		 344 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  38.51 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  37.46 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  37.32 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  34.76 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  34.38 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  30.99 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  32.05 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  28.97 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  26.49 
 
 		 226 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  33.64 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  26.56 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  29.03 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  23.08 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  25.93 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  25.58 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  23.77 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  25.53 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  21.37 
 
 		 240 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2117  hypothetical protein  25.95 
 
 		 209 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.877565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>