26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1988 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  100 
 
 		 331 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  35.79 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  37.94 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  37.46 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  34.47 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  41.44 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  32.05 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  29.53 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1358  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  29.77 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  32.62 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  30.08 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0950  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  27.92 
 
 		 411 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.181466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2527  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  27.75 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.57 
 
 		 411 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000311952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1833  beta-ketoacyl synthase  24.36 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0449277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2548  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  29.41 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1721  beta-ketoacyl synthase  26.72 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000983159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1603  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  22.73 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0116362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0347  Beta-ketoacyl synthase  26.29 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  42.7  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1764  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  25.95 
 
 		 418 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  25.79 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>