22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0383 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  42.53 
 
 
347 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  36.1 
 
 
354 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  33.33 
 
 
353 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
354 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  35.24 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 
320 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  30.68 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  29.53 
 
 
331 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  27.56 
 
 
242 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  32.59 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2192  Beta-ketoacyl synthase  28.16 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  23.31 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  25.79 
 
 
357 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  25.36 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  26.72 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  32.04 
 
 
269 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1358  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.11 
 
 
473 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1616  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  22.38 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1696  Beta-ketoacyl synthase  27.81 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  25.45 
 
 
240 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  26.36 
 
 
264 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>