27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2114 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  100 
 
 		 354 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  37.25 
 
 		 353 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  36.62 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  34.08 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  30.99 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  41.44 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  30.68 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  30 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  24.46 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  24.83 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.22 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5754  Beta-ketoacyl synthase  28.34 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1721  beta-ketoacyl synthase  27.59 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000983159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  23.67 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  43.66 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2213  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  24.24 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.399201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2192  Beta-ketoacyl synthase  23.36 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  32.56 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0960  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  28.47 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10310  Beta-ketoacyl synthase  25.37 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00489291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4857  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  25 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2092  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  20.88 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.161858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1696  Beta-ketoacyl synthase  23.31 
 
 		 346 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>