95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1087 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1087  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  100 
 
 
353 aa  718    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03860  Beta-ketoacyl synthase  51.56 
 
 
356 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0777585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1761  Beta-ketoacyl synthase  49.15 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6843  hypothetical protein  38.87 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  38.51 
 
 
347 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1867  Beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 
354 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2114  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase  37.25 
 
 
354 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.576608  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0162715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  37.46 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3605  beta-ketoacyl synthase  31.94 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0927  beta-ketoacyl synthase  25.93 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2672  beta-ketoacyl synthase  21.21 
 
 
410 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464493  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1721  beta-ketoacyl synthase  28.71 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000983159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2192  Beta-ketoacyl synthase  24.55 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.264363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2649  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  27.96 
 
 
269 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1358  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  27.09 
 
 
473 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1694  Beta-ketoacyl synthase  23.78 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10310  Beta-ketoacyl synthase  26.47 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00489291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0867  Beta-ketoacyl synthase  27.31 
 
 
423 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2261  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  26.57 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1696  Beta-ketoacyl synthase  26.34 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0459  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  26.63 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1054  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  24.63 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.454263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1848  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  23.94 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000251484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2426  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  25.12 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.878481  normal  0.972758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0950  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  24.62 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.181466  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0919  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.76 
 
 
410 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635642  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1182  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.89 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000254135  decreased coverage  0.00170514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3590  beta-ketoacyl synthase  25 
 
 
479 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.22965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1083  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.65 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0945  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  22.61 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0984  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.76 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835158  normal  0.068099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1125  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.65 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0645  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.65 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  24.63 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830846  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0129  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  22.82 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.100569  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2179  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  24.26 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.709601  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1616  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  25.13 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4277  Beta-ketoacyl synthase  25.11 
 
 
476 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0376331  normal  0.0408135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1603  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  21 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0116362  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  24.27 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000311952  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2070  beta-ketoacyl synthase  26.96 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1833  beta-ketoacyl synthase  22.48 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0449277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2494  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  23.41 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2565  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  26.11 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0124  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  26.8 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  25.96 
 
 
420 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2461  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  22.99 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0850761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0960  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  26.52 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1866  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  30.67 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2746  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  28.64 
 
 
413 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2838  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  28.64 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0173  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  23.41 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  23.64 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2548  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  24.39 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1503  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  24.76 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00474127  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0126  Beta-ketoacyl synthase-like protein  25.41 
 
 
412 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000017098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2930  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  28.64 
 
 
413 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0750  beta-ketoacyl synthase  27.27 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302137  decreased coverage  0.000178697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4189  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  29.63 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.731881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4158  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  25.81 
 
 
401 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0178  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.84 
 
 
414 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000821615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2370  beta-ketoacyl synthase  23.28 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4432  Beta-ketoacyl synthase  26.79 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.97036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1138  beta-ketoacyl synthase  27.89 
 
 
430 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1649  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  24.64 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000779788  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0640  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  21.91 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2794  beta-ketoacyl synthase  24.62 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.63005  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0983  Beta-ketoacyl synthase-like protein  22.77 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000162972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1002  Beta-ketoacyl synthase  22.77 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2735  Beta-ketoacyl synthase  27.5 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1163  RNA-binding protein  24.89 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00122458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4150  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  22.68 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0596786  decreased coverage  0.00141331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4193  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  25 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.835965  normal  0.848069 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0314  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  23.79 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1660  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  22.93 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  21.96 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.583902  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  26.67 
 
 
2391 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1528  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23.17 
 
 
422 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.640363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3830  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  24.64 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  25 
 
 
411 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  30 
 
 
2396 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1055  beta-ketoacyl synthase  26.15 
 
 
384 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1606  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  23 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0891  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  22.64 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0568  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II  22.5 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0750  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  22.33 
 
 
413 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000685785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1199  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II  22.65 
 
 
412 aa  43.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.517255  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5149  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  22.66 
 
 
416 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.766985  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3248  beta-ketoacyl synthase  25.85 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728054  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1089  Beta-ketoacyl synthase  22.67 
 
 
401 aa  42.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.349966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1038  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  22.87 
 
 
410 aa  42.7  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00016746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2596  beta-ketoacyl synthase  23.95 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0216  Beta-ketoacyl synthase  26.84 
 
 
812 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1083  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase II  22.27 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.905043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>