66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4797 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  75.63 
 
 
240 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  56.54 
 
 
242 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  44.3 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  32.64 
 
 
242 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  35.94 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  30.74 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  31.78 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  33.49 
 
 
241 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.1 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  26.2 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  28.96 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  31.75 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.03 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  31.49 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  31.49 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  29.61 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  30.94 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  27.13 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  30.94 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  27.13 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  29.65 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  30.99 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  27.17 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  28.73 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  26.13 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  32.3 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  23.61 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  30.13 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  28.66 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  29.03 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  26.69 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  34.32 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  31.18 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  36.13 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  36.13 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  34.81 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  34.81 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  32.12 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  30.3 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  37.93 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  40.23 
 
 
282 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  25.69 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  29.23 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  33.12 
 
 
267 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  34.58 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  30.85 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  27.53 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  34.78 
 
 
195 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  39.44 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  36.08 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  36.08 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  41.1 
 
 
260 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  34.78 
 
 
269 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  31.45 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  35.42 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  33.62 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2004  hypothetical protein  21.37 
 
 
347 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1988  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase-like protein  25.79 
 
 
331 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>