54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2171 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  58.93 
 
 
225 aa  270  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  42.28 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  30.48 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  35.88 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  43.16 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  36.84 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  30.13 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  42.39 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  28.8 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  31.18 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  29.53 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  31.62 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  36.43 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  32.47 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  40.38 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  30.18 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  39.29 
 
 
283 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  29.81 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  39.24 
 
 
260 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  26.24 
 
 
246 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  39.24 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  32.33 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  29.34 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  38.64 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  26.13 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  27.54 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  29.77 
 
 
242 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  29.23 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  29.2 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  29.17 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  31.62 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  32.03 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  29.3 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  37.93 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  25.99 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  32.63 
 
 
278 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  29.41 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  31.65 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  27.33 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  27.33 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  27.83 
 
 
294 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  29.79 
 
 
264 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>