64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3993 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  55.09 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  51.91 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  51.54 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  52.33 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  51.53 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  50.76 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  49.62 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  49.24 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  51.54 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  46.44 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  46.44 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  51.52 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  51.15 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  50.38 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  45.91 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  41.79 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  42.04 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  34.98 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  36.36 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  40.21 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  33.13 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  32.3 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  30.72 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  31.61 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  29.65 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  30.54 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  30.54 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  28.89 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  28.89 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  30.12 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  28.33 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  29.71 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  26.53 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  27.92 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  29.87 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  31.17 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  35.92 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  29.49 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  27.75 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  30.85 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  29.94 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  31.03 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  30.13 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  28.33 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  27.98 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  33.94 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  30.46 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  32.31 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  26.42 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  27.17 
 
 		 231 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  25.99 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  35.16 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  34.11 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  36.54 
 
 		 195 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  30.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  32.8 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>