52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4760 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  67.01 
 
 		 195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  60.89 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  54.19 
 
 		 260 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  56.74 
 
 		 248 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  53.77 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  54.77 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  42.42 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  42.42 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  41.41 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  40.61 
 
 		 247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  40.82 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  44.79 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  40.82 
 
 		 245 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  40.22 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  42.08 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  43.33 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  48.18 
 
 		 246 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  45.8 
 
 		 259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  39.2 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  43.15 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  43.9 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  34.55 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  37.63 
 
 		 241 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  34.38 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  41.58 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  39.23 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  31 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  36.31 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  30.5 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  46.84 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  36.92 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  27.8 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  34.23 
 
 		 253 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  27.46 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  39.13 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  38.64 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  29.09 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  38.71 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  36.08 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  31.47 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  34.42 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  34.42 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  36.13 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  42.47 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  30.28 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  30.99 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  32.99 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>