66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0448 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0448  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  85.43 
 
 
244 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  85.43 
 
 
244 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  85.43 
 
 
244 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  84.21 
 
 
244 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  72.98 
 
 
245 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  72.58 
 
 
244 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  72.58 
 
 
245 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4366  hypothetical protein  73.39 
 
 
246 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  54.34 
 
 
259 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  55.65 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  49.8 
 
 
242 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  52 
 
 
244 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  50.61 
 
 
238 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  51.22 
 
 
241 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2105  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.483871  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4760  hypothetical protein  40.61 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00298673  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3683  hypothetical protein  40.61 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  34.54 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  39.56 
 
 
226 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  32.79 
 
 
239 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  32.4 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  32.61 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4072  hypothetical protein  45.67 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3597  hypothetical protein  45.67 
 
 
231 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  32.38 
 
 
239 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  39.16 
 
 
234 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00799  hypothetical protein  39.29 
 
 
195 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  31.78 
 
 
238 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  44.62 
 
 
248 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3065  hypothetical protein  41.35 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4567  hypothetical protein  29.64 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1486  hypothetical protein  34.72 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  30.73 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  27.27 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  29.61 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1316  hypothetical protein  34.35 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0233614  hitchhiker  0.0084742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  28.8 
 
 
286 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.47 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0439  hypothetical protein  23.96 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0815412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  28.4 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  28.33 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  29.03 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  29.73 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  36.72 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  28.93 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  28.93 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  27.16 
 
 
267 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  24.88 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  25.78 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  29.17 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  29.17 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  31.62 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  25.99 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  25.45 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  26.94 
 
 
272 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  26.94 
 
 
272 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  26.44 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  25.98 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  25.91 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  31.03 
 
 
269 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2122  hypothetical protein  28.68 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  24.87 
 
 
277 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>