35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01140 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01140  Tfp pilus assembly protein PilV  100 
 
 		 136 aa  269  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  57.66 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0667  hypothetical protein  48.92 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  57.28 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2933  hypothetical protein  35.29 
 
 		 393 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2944  fimbrial biogenesis protein  29.01 
 
 		 362 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104726  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  26.95 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  32.81 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  26.06 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  37.14 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  27.46 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  30.65 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  26.76 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  26.76 
 
 		 195 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  34.15 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  36.54 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  34.48 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  45.24 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0216  hypothetical protein  25.4 
 
 		 551 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.590946  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  26.06 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  30.25 
 
 		 880 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  28.57 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  45.24 
 
 		 159 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3118  type IV pilin  23.39 
 
 		 215 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.289417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 188 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  29.9 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  40.32 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  32.08 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  37.74 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  35.59 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0995  hypothetical protein  35.48 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  34.72 
 
 		 179 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  34.72 
 
 		 179 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>