24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2944 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2944  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 362 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104726  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2933  hypothetical protein  27.15 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0216  hypothetical protein  29.68 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.590946  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0667  hypothetical protein  24.82 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  26.62 
 
 		 137 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  42.37 
 
 		 125 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  50 
 
 		 170 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  44.07 
 
 		 182 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  24 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  39.29 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01140  Tfp pilus assembly protein PilV  29.01 
 
 		 136 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  39.29 
 
 		 160 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  32.89 
 
 		 159 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  31.67 
 
 		 171 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  32.89 
 
 		 159 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  37.29 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3164  prepilin-type cleavage/methylation-like  32.08 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00552698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  24.02 
 
 		 880 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1826  hypothetical protein  36 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252754  normal  0.485883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  38.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  31.82 
 
 		 185 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3118  type IV pilin  28 
 
 		 215 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.289417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3023  hypothetical protein  29.84 
 
 		 437 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  24.42 
 
 		 171 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>