59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000452 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000452  hypothetical protein  100 
 
 		 1591 aa  3285    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06209  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1585 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05874  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1211 aa  80.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.51 
 
 		 369 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 		 369 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  32.19 
 
 		 366 aa  57.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1255  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  35.23 
 
 		 159 aa  57  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.821556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 369 aa  56.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 363 aa  55.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 372 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.28 
 
 		 373 aa  54.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 		 372 aa  54.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  27.66 
 
 		 370 aa  53.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  25.81 
 
 		 345 aa  51.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  25.71 
 
 		 422 aa  51.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  26.05 
 
 		 337 aa  50.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  50.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.43 
 
 		 510 aa  50.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 263 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 263 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  26.28 
 
 		 487 aa  49.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  33.96 
 
 		 261 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  33.96 
 
 		 261 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.34 
 
 		 712 aa  49.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  26.05 
 
 		 337 aa  48.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 365 aa  48.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  25 
 
 		 466 aa  48.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.94 
 
 		 457 aa  48.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  25.9 
 
 		 170 aa  47.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 		 440 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 262 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1512  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 478 aa  47.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  25.74 
 
 		 630 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 264 aa  47  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  34.12 
 
 		 227 aa  47  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 202 aa  47  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 202 aa  47  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 261 aa  46.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  33.68 
 
 		 373 aa  46.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  32.93 
 
 		 202 aa  46.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  37.66 
 
 		 182 aa  46.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.97 
 
 		 199 aa  46.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 185 aa  46.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  33.93 
 
 		 230 aa  46.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 263 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  37.66 
 
 		 182 aa  46.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  28.16 
 
 		 189 aa  45.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.04 
 
 		 260 aa  46.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  38.89 
 
 		 182 aa  45.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.78 
 
 		 640 aa  45.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  25.4 
 
 		 170 aa  45.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 412 aa  45.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 202 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 232 aa  45.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  20.89 
 
 		 656 aa  45.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 202 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  27.72 
 
 		 327 aa  45.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  26.98 
 
 		 524 aa  45.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 367 aa  45.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>