More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05874 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05874  hypothetical protein  100 
 
 		 1211 aa  2509    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06209  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1585 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000452  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1591 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  38.79 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  31.51 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.85 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.92 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  39.02 
 
 		 415 aa  62  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  27.27 
 
 		 427 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.94 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  28.87 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  30.53 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.83 
 
 		 286 aa  57.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.29 
 
 		 337 aa  57.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  45 
 
 		 321 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 440 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.51 
 
 		 407 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.16 
 
 		 223 aa  58.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 176 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  28.77 
 
 		 261 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  36.7 
 
 		 569 aa  57  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.19 
 
 		 240 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  25.54 
 
 		 1755 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  30.83 
 
 		 263 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 210 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  33.1 
 
 		 223 aa  55.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  33.59 
 
 		 345 aa  56.2  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  42.67 
 
 		 443 aa  55.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  36.26 
 
 		 345 aa  55.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 333 aa  55.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 237 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 263 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  30.08 
 
 		 263 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  33.6 
 
 		 439 aa  55.1  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 244 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.09 
 
 		 429 aa  55.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.39 
 
 		 670 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 189 aa  55.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.49 
 
 		 525 aa  55.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 638 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 227 aa  54.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 459 aa  54.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  30.08 
 
 		 262 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.45 
 
 		 365 aa  54.3  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 1026 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 294 aa  54.3  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.25 
 
 		 224 aa  54.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 417 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  38.53 
 
 		 330 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  28 
 
 		 271 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  27.23 
 
 		 478 aa  53.5  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  30.07 
 
 		 344 aa  53.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 		 537 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 		 263 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 637 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  34.78 
 
 		 364 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0186  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 192 aa  53.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.08 
 
 		 320 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 		 768 aa  53.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 361 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 207 aa  53.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  28.4 
 
 		 261 aa  53.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.11 
 
 		 328 aa  53.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  37.23 
 
 		 331 aa  52.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 		 310 aa  52  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  30.87 
 
 		 376 aa  52  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 231 aa  52  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  37.23 
 
 		 310 aa  52  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  30.91 
 
 		 218 aa  52  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.64 
 
 		 542 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  36.11 
 
 		 319 aa  52.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 		 630 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  31.62 
 
 		 510 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  29.49 
 
 		 447 aa  52  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  30.51 
 
 		 445 aa  52  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  34.45 
 
 		 617 aa  52  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 459 aa  52  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  30.7 
 
 		 261 aa  52  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  30.7 
 
 		 261 aa  52  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 673 aa  52  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.26 
 
 		 166 aa  51.6  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  30.94 
 
 		 270 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 356 aa  51.6  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  31.93 
 
 		 350 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  36.11 
 
 		 319 aa  50.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  31.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  32.11 
 
 		 240 aa  51.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.52 
 
 		 521 aa  51.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  28.88 
 
 		 317 aa  50.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 230 aa  51.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  29.46 
 
 		 333 aa  50.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 		 217 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.75 
 
 		 631 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>