More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000423 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000423  multidrug resistance protein D  100 
 
 		 378 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.575568  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  66.39 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3551  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.06 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3307  multidrug resistance protein D  59.95 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.635246  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3485  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  48.42 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.09 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  48.83 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.83 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3276  multidrug resistance protein D  53.58 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.26 
 
 		 389 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.43 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1082  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  51.1 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04859  hypothetical protein  44.81 
 
 		 434 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0579  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  50.39 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1082  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  49.18 
 
 		 395 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2693  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.693922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.62 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.62 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.05 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.81 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.76 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.76 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.91 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.47 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.47 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_4263  MFS family transporter  36.26 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0514386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50050  MFS family transporter  33.93 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.012942 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.28 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.89 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.99 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.5 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.06 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.49 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.98 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  25.14 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.98 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.98 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009456  VC0395_1015  multidrug resistance protein D  28.57 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  28.46 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_3477  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.83 
 
 		 126 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.74 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.86 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.2 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5152  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600108 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.8 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.33 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  29.54 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.64 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.05 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.89 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  24.78 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.68 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  24.25 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.01 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.7 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.54 
 
 		 401 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  28.18 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  26.98 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  26.37 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.67 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.67 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.72 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  27.67 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.84 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.05 
 
 		 412 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.61 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  27.23 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  26.09 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.71 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1915  inner membrane transport protein YdhC  24.84 
 
 		 401 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  28 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1561  inner membrane transport protein YdhC  24.84 
 
 		 401 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00165154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.53 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.94 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1746  inner membrane transport protein YdhC  25.39 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000953992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1524  inner membrane transport protein YdhC  24.84 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  28 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  28 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1538  inner membrane transport protein YdhC  24.84 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0173263  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  25.98 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.57 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0558  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.24 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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