More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0001 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
457 aa  917    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  33.03 
 
 
453 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0001  chromosomal replication initiation protein  32.25 
 
 
450 aa  177  5e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.58 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.04 
 
 
469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
454 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  27.61 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  27.7 
 
 
460 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.14 
 
 
458 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
443 aa  160  6e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  28.66 
 
 
456 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.62 
 
 
515 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.53 
 
 
452 aa  156  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.42 
 
 
480 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.29 
 
 
439 aa  156  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  27.86 
 
 
482 aa  156  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  25.17 
 
 
453 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.63 
 
 
437 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000928481  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.2 
 
 
448 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.41 
 
 
453 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  25.93 
 
 
450 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 
453 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.54 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  25.39 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  26.48 
 
 
464 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  27.21 
 
 
441 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  25.99 
 
 
466 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  26.22 
 
 
450 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.07 
 
 
439 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  26.65 
 
 
464 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  29.13 
 
 
460 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  27.86 
 
 
478 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.39 
 
 
443 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  29.13 
 
 
458 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0001  chromosomal replication initiation protein  29.17 
 
 
464 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.789649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.27 
 
 
444 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.01 
 
 
476 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  29.88 
 
 
468 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  28.61 
 
 
452 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  27.46 
 
 
454 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  30 
 
 
468 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  26.38 
 
 
442 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  30 
 
 
472 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  30 
 
 
468 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.78 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  30.34 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  30.18 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.27 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  29.91 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  26.13 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.36 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  27.24 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  24.36 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  25.94 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  27.19 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.75 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.92 
 
 
503 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.51 
 
 
453 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  26.59 
 
 
452 aa  147  6e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  28.53 
 
 
460 aa  147  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  28.36 
 
 
445 aa  146  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  27 
 
 
460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  29.12 
 
 
457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  28.4 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  26.22 
 
 
477 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  28.4 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  29.72 
 
 
473 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  29.72 
 
 
473 aa  146  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0001  chromosomal replication initiation protein  29.35 
 
 
459 aa  146  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  29.12 
 
 
457 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  28.19 
 
 
440 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  28.19 
 
 
440 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  29.79 
 
 
440 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  29.29 
 
 
483 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  27.01 
 
 
446 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  27.01 
 
 
446 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  28.3 
 
 
450 aa  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0001  chromosomal replication initiation protein  29.05 
 
 
470 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  30.29 
 
 
524 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  26.01 
 
 
446 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  28.19 
 
 
440 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  30.23 
 
 
522 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  28.38 
 
 
462 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  26.79 
 
 
446 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  27.23 
 
 
461 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  28.37 
 
 
462 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.49 
 
 
468 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  28.37 
 
 
462 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  29.28 
 
 
463 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  28.37 
 
 
462 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  25.68 
 
 
446 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  25.81 
 
 
448 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  28.37 
 
 
462 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  27.61 
 
 
451 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  27.71 
 
 
455 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>