150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2545 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 
815 aa  1657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.25 
 
 
790 aa  803    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  57.76 
 
 
789 aa  870    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.56 
 
 
812 aa  954    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  53.13 
 
 
801 aa  800    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  57.23 
 
 
806 aa  869    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  63.03 
 
 
808 aa  998    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  63.88 
 
 
806 aa  1029    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  55.2 
 
 
806 aa  829    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.62 
 
 
800 aa  833    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  54.62 
 
 
761 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  57.01 
 
 
792 aa  833    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  27.17 
 
 
782 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  24.87 
 
 
835 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  24.81 
 
 
828 aa  117  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  25.51 
 
 
851 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  25.45 
 
 
832 aa  115  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  24.42 
 
 
837 aa  114  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  23.92 
 
 
780 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  24.1 
 
 
791 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  24.1 
 
 
791 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  24.31 
 
 
825 aa  111  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  25.96 
 
 
1230 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  25.96 
 
 
1230 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  28.13 
 
 
800 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  25.29 
 
 
811 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  26.87 
 
 
800 aa  108  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.61 
 
 
831 aa  107  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  25.96 
 
 
1228 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  26.06 
 
 
811 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  25.73 
 
 
811 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  24.39 
 
 
811 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  25.9 
 
 
771 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  25.99 
 
 
784 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  25.25 
 
 
798 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  25.88 
 
 
802 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  24.96 
 
 
832 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.1 
 
 
824 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  25 
 
 
860 aa  104  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  25.03 
 
 
823 aa  104  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  25.49 
 
 
820 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  25.44 
 
 
796 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  23.96 
 
 
787 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  24.6 
 
 
795 aa  101  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4985  Phosphoketolase  28.19 
 
 
784 aa  101  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  25.76 
 
 
792 aa  100  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  24.88 
 
 
833 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  22.69 
 
 
788 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  23.69 
 
 
796 aa  100  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0915  putative phosphoketolase  22.52 
 
 
788 aa  99.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0207514  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23.26 
 
 
810 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  26.03 
 
 
789 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  26.12 
 
 
792 aa  99.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  24.96 
 
 
790 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  24.23 
 
 
812 aa  98.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  24.53 
 
 
800 aa  98.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  25.77 
 
 
791 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1282  putative phosphoketolase  23.07 
 
 
788 aa  98.2  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0002253  normal  0.0247047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  23.85 
 
 
851 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  24.92 
 
 
797 aa  97.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  22.53 
 
 
794 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  24.71 
 
 
848 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  22.47 
 
 
805 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  22.7 
 
 
783 aa  96.3  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  23.85 
 
 
793 aa  96.7  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  25.55 
 
 
823 aa  95.1  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  28.43 
 
 
802 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3504  phosphoketolase  25.71 
 
 
772 aa  95.5  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705245  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  22.79 
 
 
792 aa  95.1  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  22.99 
 
 
788 aa  95.5  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  23.89 
 
 
820 aa  95.5  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  25.54 
 
 
797 aa  95.1  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  25.85 
 
 
802 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  22.68 
 
 
789 aa  94.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  22.99 
 
 
788 aa  94.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  24.21 
 
 
788 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  23.87 
 
 
793 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  22.38 
 
 
788 aa  93.2  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  23.37 
 
 
818 aa  93.2  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  24.61 
 
 
813 aa  92.8  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  22.12 
 
 
788 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  23.19 
 
 
795 aa  93.2  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  25 
 
 
793 aa  92.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  24.3 
 
 
784 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  24.85 
 
 
823 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  26.16 
 
 
783 aa  92.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  25.3 
 
 
793 aa  92  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  23.13 
 
 
813 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  24.46 
 
 
782 aa  91.3  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  24.62 
 
 
1305 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  23 
 
 
815 aa  90.9  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  26.25 
 
 
811 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  23 
 
 
815 aa  90.9  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  24.19 
 
 
797 aa  90.5  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  25.11 
 
 
797 aa  90.1  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  24.74 
 
 
797 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  24.66 
 
 
791 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  23.77 
 
 
783 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  23.45 
 
 
803 aa  89  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  25.08 
 
 
798 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>