154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1947 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  67.05 
 
 
832 aa  1111    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  66.11 
 
 
796 aa  1106    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  56.74 
 
 
811 aa  931    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  47.36 
 
 
792 aa  755    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  71.05 
 
 
789 aa  1192    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  42.21 
 
 
788 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  56.27 
 
 
835 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  52.98 
 
 
834 aa  901    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  64.18 
 
 
824 aa  1048    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  66.5 
 
 
788 aa  1064    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  63.52 
 
 
792 aa  1016    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  52.99 
 
 
792 aa  855    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  65.47 
 
 
812 aa  1085    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  58.91 
 
 
802 aa  1005    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  100 
 
 
795 aa  1649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  67.22 
 
 
793 aa  1142    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  73.01 
 
 
811 aa  1226    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  67.27 
 
 
804 aa  1113    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  67.35 
 
 
809 aa  1109    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  59.42 
 
 
796 aa  962    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  68.35 
 
 
807 aa  1145    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  57.44 
 
 
1228 aa  912    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  66.2 
 
 
802 aa  1061    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  66.11 
 
 
784 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  64.86 
 
 
784 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  65.01 
 
 
791 aa  1045    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  65.01 
 
 
791 aa  1045    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  56.36 
 
 
797 aa  930    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  42.61 
 
 
788 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  65.73 
 
 
784 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  66.2 
 
 
793 aa  1098    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  71.21 
 
 
802 aa  1190    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  65.98 
 
 
806 aa  1070    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  77.57 
 
 
800 aa  1306    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  66.67 
 
 
833 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  57.69 
 
 
1230 aa  915    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  42.08 
 
 
788 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  42.08 
 
 
788 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  42.79 
 
 
788 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  42.17 
 
 
788 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  58.64 
 
 
821 aa  987    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  46.2 
 
 
794 aa  745    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  45.98 
 
 
817 aa  718    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  46.9 
 
 
818 aa  761    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  47.89 
 
 
788 aa  766    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  44.83 
 
 
813 aa  717    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  61.09 
 
 
811 aa  1008    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  41.95 
 
 
788 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  64.89 
 
 
797 aa  1067    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  66.15 
 
 
798 aa  1090    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0915  putative phosphoketolase  43.09 
 
 
788 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0207514  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  65.98 
 
 
806 aa  1070    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  62.08 
 
 
832 aa  1036    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  56.26 
 
 
815 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  62.78 
 
 
790 aa  1056    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  65.6 
 
 
811 aa  1104    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  57.9 
 
 
802 aa  986    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  41.95 
 
 
788 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  65.86 
 
 
806 aa  1069    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  62.55 
 
 
823 aa  1045    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  62.25 
 
 
800 aa  1033    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  71.72 
 
 
794 aa  1209    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  71.21 
 
 
794 aa  1204    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  54.33 
 
 
820 aa  888    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  73.7 
 
 
805 aa  1240    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  70.54 
 
 
792 aa  1189    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  60.81 
 
 
791 aa  999    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  47.23 
 
 
803 aa  773    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  63.68 
 
 
790 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  64.68 
 
 
797 aa  1071    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  60.63 
 
 
820 aa  988    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  42.17 
 
 
788 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  71.85 
 
 
795 aa  1207    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  57.23 
 
 
1305 aa  922    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  53.88 
 
 
813 aa  920    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  42.62 
 
 
788 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  64.99 
 
 
789 aa  1072    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  66.07 
 
 
802 aa  1061    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  56.04 
 
 
811 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  62.75 
 
 
800 aa  1035    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  42.17 
 
 
788 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  65.73 
 
 
811 aa  1107    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  73.01 
 
 
811 aa  1226    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  67.22 
 
 
851 aa  1087    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  67.64 
 
 
860 aa  1108    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  66.37 
 
 
783 aa  1068    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  68.21 
 
 
832 aa  1084    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  65.17 
 
 
795 aa  1076    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  56.23 
 
 
794 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  56.62 
 
 
797 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  73.17 
 
 
811 aa  1231    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  66.37 
 
 
791 aa  1107    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  51.19 
 
 
825 aa  830    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  64.62 
 
 
783 aa  1069    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  52.69 
 
 
793 aa  844    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  67.68 
 
 
798 aa  1129    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  68.55 
 
 
795 aa  1135    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  57.82 
 
 
1230 aa  918    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  55.46 
 
 
835 aa  905    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  56.26 
 
 
815 aa  939    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>