153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1896 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  68.93 
 
 
783 aa  1107    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  68.12 
 
 
796 aa  1124    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  61.16 
 
 
811 aa  991    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  47.64 
 
 
792 aa  748    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  71.65 
 
 
789 aa  1190    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  69.67 
 
 
797 aa  1135    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  56.84 
 
 
835 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  54.97 
 
 
834 aa  930    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  67.31 
 
 
832 aa  1099    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  69.11 
 
 
788 aa  1108    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  63.83 
 
 
792 aa  1039    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  72.73 
 
 
794 aa  1238    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  69.66 
 
 
812 aa  1130    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  60.2 
 
 
1230 aa  968    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  71.21 
 
 
795 aa  1190    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  69.31 
 
 
793 aa  1177    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  61.01 
 
 
802 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  70.84 
 
 
804 aa  1177    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  70.16 
 
 
809 aa  1167    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  63.41 
 
 
796 aa  1024    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  71.09 
 
 
807 aa  1196    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  60.84 
 
 
1228 aa  974    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  70.65 
 
 
802 aa  1117    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  67.61 
 
 
784 aa  1053    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  67.35 
 
 
784 aa  1082    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  63.34 
 
 
791 aa  1031    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  63.34 
 
 
791 aa  1031    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  62.41 
 
 
797 aa  1032    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  42.52 
 
 
788 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  67.22 
 
 
784 aa  1075    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  68.02 
 
 
793 aa  1131    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  100 
 
 
802 aa  1664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  68.66 
 
 
806 aa  1107    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  73.82 
 
 
800 aa  1231    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  62.14 
 
 
820 aa  1020    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  68.7 
 
 
811 aa  1145    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  67.47 
 
 
800 aa  1125    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  60.08 
 
 
787 aa  989    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  41.79 
 
 
788 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  54.06 
 
 
792 aa  874    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  57.76 
 
 
815 aa  963    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  48.81 
 
 
794 aa  791    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  46.03 
 
 
817 aa  715    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  47.87 
 
 
818 aa  779    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  48.23 
 
 
788 aa  761    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  45.08 
 
 
813 aa  705    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  64.18 
 
 
811 aa  1049    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  63.69 
 
 
823 aa  1045    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  68.32 
 
 
797 aa  1115    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  66.97 
 
 
798 aa  1097    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
824 aa  1103    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  68.66 
 
 
806 aa  1107    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  65.31 
 
 
832 aa  1069    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  62.21 
 
 
821 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  65.94 
 
 
790 aa  1082    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  57.25 
 
 
813 aa  977    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  61.14 
 
 
802 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  73.11 
 
 
794 aa  1234    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  68.54 
 
 
806 aa  1106    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  41.1 
 
 
788 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  65.15 
 
 
823 aa  1077    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  65.95 
 
 
800 aa  1073    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  66.71 
 
 
789 aa  1101    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  66.75 
 
 
833 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  56.49 
 
 
820 aa  911    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  83.21 
 
 
805 aa  1387    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  71.26 
 
 
792 aa  1186    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  61.76 
 
 
791 aa  1003    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  47.99 
 
 
803 aa  790    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  67.7 
 
 
790 aa  1120    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  66.58 
 
 
797 aa  1098    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  76.03 
 
 
811 aa  1259    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  49.3 
 
 
782 aa  739    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  68.91 
 
 
795 aa  1169    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  59.75 
 
 
1305 aa  975    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  55.09 
 
 
835 aa  917    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  41.48 
 
 
788 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  70.23 
 
 
802 aa  1109    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  56.52 
 
 
811 aa  883    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  66.71 
 
 
800 aa  1076    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  62.18 
 
 
820 aa  993    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  68.7 
 
 
811 aa  1144    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  76.03 
 
 
811 aa  1259    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  68.2 
 
 
851 aa  1103    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  68.16 
 
 
860 aa  1115    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  62.58 
 
 
810 aa  1054    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  66.54 
 
 
832 aa  1090    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  67.01 
 
 
795 aa  1118    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  59.69 
 
 
794 aa  977    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  62.28 
 
 
797 aa  1041    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  75.54 
 
 
811 aa  1249    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  69.03 
 
 
791 aa  1158    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  49.87 
 
 
825 aa  803    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  67.61 
 
 
783 aa  1105    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  48.92 
 
 
793 aa  805    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  70.46 
 
 
798 aa  1168    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  70.33 
 
 
795 aa  1177    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  60.64 
 
 
1230 aa  971    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  61.01 
 
 
802 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  57.76 
 
 
815 aa  963    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>