156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4367 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  61.06 
 
 		 815 aa  1021    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  61.44 
 
 		 811 aa  1024    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  49.81 
 
 		 792 aa  798    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  65.51 
 
 		 789 aa  1103    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  41.99 
 
 		 788 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  54.99 
 
 		 835 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  57.14 
 
 		 834 aa  972    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  41.23 
 
 		 851 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  68.92 
 
 		 788 aa  1113    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  63.47 
 
 		 792 aa  1045    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  67.72 
 
 		 812 aa  1122    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  63.57 
 
 		 802 aa  1087    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  66.2 
 
 		 795 aa  1098    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  72.38 
 
 		 793 aa  1221    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  64.74 
 
 		 821 aa  1097    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  71 
 
 		 804 aa  1208    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  70.16 
 
 		 809 aa  1153    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  61.9 
 
 		 796 aa  1018    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  70.62 
 
 		 807 aa  1198    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  61.19 
 
 		 1228 aa  1002    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  68.49 
 
 		 802 aa  1100    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  67.01 
 
 		 784 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  66.62 
 
 		 784 aa  1088    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  65.26 
 
 		 796 aa  1083    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  63.67 
 
 		 791 aa  1059    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  63.67 
 
 		 791 aa  1059    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  63.23 
 
 		 797 aa  1036    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  42.66 
 
 		 788 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  65.81 
 
 		 784 aa  1065    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  100 
 
 		 793 aa  1648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  68.02 
 
 		 802 aa  1131    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  66.29 
 
 		 806 aa  1090    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  65.95 
 
 		 800 aa  1087    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  64.74 
 
 		 833 aa  1063    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  58.91 
 
 		 813 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  42.41 
 
 		 788 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  64.23 
 
 		 794 aa  1084    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  61.29 
 
 		 820 aa  1025    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  51.52 
 
 		 794 aa  820    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  48.64 
 
 		 817 aa  762    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  49.43 
 
 		 818 aa  807    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  50.38 
 
 		 788 aa  818    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  47.48 
 
 		 813 aa  741    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  61.5 
 
 		 811 aa  1028    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  41.65 
 
 		 788 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  66.62 
 
 		 797 aa  1102    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  66.49 
 
 		 798 aa  1107    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0915  putative phosphoketolase  42.91 
 
 		 788 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0207514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  66.29 
 
 		 806 aa  1090    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  63.99 
 
 		 832 aa  1070    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  66.62 
 
 		 811 aa  1113    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  66.16 
 
 		 790 aa  1089    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  70.6 
 
 		 811 aa  1174    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  62.56 
 
 		 802 aa  1065    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  66.16 
 
 		 806 aa  1089    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  41.57 
 
 		 788 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  65.38 
 
 		 823 aa  1100    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  66.75 
 
 		 800 aa  1115    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1051  putative phosphoketolase  41.49 
 
 		 788 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.414026  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  61.06 
 
 		 815 aa  1021    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  59.04 
 
 		 820 aa  983    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  67.42 
 
 		 805 aa  1132    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  64.64 
 
 		 792 aa  1101    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  60.59 
 
 		 791 aa  1001    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  50.38 
 
 		 803 aa  833    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  68 
 
 		 790 aa  1145    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  77.48 
 
 		 797 aa  1318    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  61.06 
 
 		 1230 aa  1004    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  63.75 
 
 		 795 aa  1088    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  61.81 
 
 		 1305 aa  1007    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  54.76 
 
 		 792 aa  898    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  42.09 
 
 		 788 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  41.32 
 
 		 788 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  68.11 
 
 		 802 aa  1091    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  54.14 
 
 		 811 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  67.17 
 
 		 800 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  41.61 
 
 		 788 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  58.04 
 
 		 835 aa  969    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  70.73 
 
 		 811 aa  1176    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  66.5 
 
 		 811 aa  1114    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  64.36 
 
 		 851 aa  1040    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  64.24 
 
 		 860 aa  1063    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1282  putative phosphoketolase  41.83 
 
 		 788 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0002253  normal  0.0247047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  63.51 
 
 		 832 aa  1026    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  67.05 
 
 		 795 aa  1129    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  62.5 
 
 		 794 aa  1029    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  64.25 
 
 		 797 aa  1054    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  67 
 
 		 811 aa  1117    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  69.42 
 
 		 791 aa  1176    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  49.49 
 
 		 825 aa  798    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  66.28 
 
 		 783 aa  1106    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  52.08 
 
 		 793 aa  863    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  69.81 
 
 		 798 aa  1167    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  70.33 
 
 		 795 aa  1181    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  61.31 
 
 		 1230 aa  1009    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>