151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1712 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  59.8 
 
 		 797 aa  998    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  67.41 
 
 		 811 aa  1156    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  43.82 
 
 		 792 aa  700    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  57.27 
 
 		 789 aa  949    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  60.67 
 
 		 792 aa  978    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  50.5 
 
 		 835 aa  836    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  71.06 
 
 		 834 aa  1261    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  58.49 
 
 		 788 aa  964    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  55.81 
 
 		 792 aa  935    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  58.53 
 
 		 794 aa  968    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  59.67 
 
 		 812 aa  987    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  67.09 
 
 		 802 aa  1170    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  56.26 
 
 		 795 aa  939    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  61.75 
 
 		 793 aa  1058    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  66.04 
 
 		 802 aa  1148    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  59.27 
 
 		 804 aa  1023    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  60.36 
 
 		 809 aa  998    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  67.47 
 
 		 796 aa  1120    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  59.72 
 
 		 807 aa  1021    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  66.67 
 
 		 1228 aa  1134    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  59.64 
 
 		 802 aa  969    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  60.54 
 
 		 784 aa  949    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  59.9 
 
 		 784 aa  959    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  57.77 
 
 		 791 aa  948    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  57.77 
 
 		 791 aa  948    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  68.37 
 
 		 797 aa  1140    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  56.65 
 
 		 783 aa  949    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  58.88 
 
 		 784 aa  944    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  61.06 
 
 		 793 aa  1021    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  57.76 
 
 		 802 aa  963    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  58.13 
 
 		 806 aa  968    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  56.94 
 
 		 800 aa  947    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  66.05 
 
 		 1230 aa  1131    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  58.65 
 
 		 792 aa  982    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  54.89 
 
 		 810 aa  927    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  48.76 
 
 		 823 aa  768    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  56.46 
 
 		 837 aa  961    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  58.13 
 
 		 800 aa  989    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  69.5 
 
 		 821 aa  1210    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  47.52 
 
 		 794 aa  741    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  43.8 
 
 		 817 aa  686    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  45.33 
 
 		 818 aa  734    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  45.62 
 
 		 788 aa  724    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  43.8 
 
 		 813 aa  684    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  54.14 
 
 		 811 aa  908    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  54.51 
 
 		 820 aa  911    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  60.86 
 
 		 797 aa  996    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  59.97 
 
 		 798 aa  986    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  54.3 
 
 		 823 aa  925    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  58.13 
 
 		 806 aa  968    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  55.07 
 
 		 832 aa  926    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  56.69 
 
 		 833 aa  924    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  58.76 
 
 		 790 aa  954    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  100 
 
 		 815 aa  1701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  58.79 
 
 		 811 aa  985    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  66.04 
 
 		 802 aa  1149    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  58 
 
 		 806 aa  967    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  53.44 
 
 		 787 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  56.18 
 
 		 823 aa  961    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  57.76 
 
 		 800 aa  973    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  58.46 
 
 		 794 aa  973    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  64.69 
 
 		 813 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  80.2 
 
 		 820 aa  1360    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  58.44 
 
 		 805 aa  977    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  57.14 
 
 		 792 aa  946    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  54.97 
 
 		 791 aa  894    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  45.02 
 
 		 803 aa  738    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  57.44 
 
 		 790 aa  969    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  60.98 
 
 		 797 aa  1017    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  53.62 
 
 		 820 aa  907    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  56.92 
 
 		 789 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  55.85 
 
 		 795 aa  952    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  67.65 
 
 		 1305 aa  1148    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  60.69 
 
 		 811 aa  1010    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  55.95 
 
 		 824 aa  954    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  56.27 
 
 		 832 aa  926    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  57.29 
 
 		 802 aa  958    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  48.99 
 
 		 811 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  57.36 
 
 		 800 aa  961    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  46.1 
 
 		 782 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  60.69 
 
 		 811 aa  1011    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  58.92 
 
 		 811 aa  985    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  57.47 
 
 		 851 aa  920    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  57.47 
 
 		 860 aa  950    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  58.08 
 
 		 783 aa  920    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  56.12 
 
 		 832 aa  887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  58.27 
 
 		 795 aa  961    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  65.57 
 
 		 794 aa  1095    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  68.11 
 
 		 797 aa  1144    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  58.42 
 
 		 811 aa  976    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  58.53 
 
 		 791 aa  980    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  46.9 
 
 		 825 aa  747    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  61.17 
 
 		 783 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  46.98 
 
 		 793 aa  761    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  60.28 
 
 		 798 aa  1001    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  61.7 
 
 		 795 aa  1036    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  66.92 
 
 		 1230 aa  1132    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  51.84 
 
 		 835 aa  858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  100 
 
 		 815 aa  1701    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  56.06 
 
 		 796 aa  937    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>