150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1497 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  63.03 
 
 
815 aa  986    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.72 
 
 
790 aa  860    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.9 
 
 
789 aa  900    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  56.48 
 
 
806 aa  836    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.98 
 
 
812 aa  907    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  54.93 
 
 
801 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.91 
 
 
806 aa  871    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 
808 aa  1642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  77.27 
 
 
806 aa  1274    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  55.4 
 
 
800 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  55.53 
 
 
761 aa  787    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  60.03 
 
 
792 aa  849    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  24.17 
 
 
780 aa  117  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  25.99 
 
 
851 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  24.77 
 
 
783 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  23.55 
 
 
825 aa  107  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.99 
 
 
831 aa  107  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  22.69 
 
 
793 aa  107  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  26.32 
 
 
782 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  26.07 
 
 
811 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  23.2 
 
 
795 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  24.57 
 
 
811 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  25.65 
 
 
1230 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  25.65 
 
 
1230 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  25.25 
 
 
835 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  25.61 
 
 
811 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  23.8 
 
 
802 aa  99.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  25.7 
 
 
791 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  23.16 
 
 
805 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  24.4 
 
 
796 aa  97.8  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  25.65 
 
 
832 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  24.79 
 
 
1228 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  24.25 
 
 
771 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  22.81 
 
 
796 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  22.88 
 
 
792 aa  95.9  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  22.97 
 
 
815 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  22.97 
 
 
815 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  24.31 
 
 
784 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  24.04 
 
 
800 aa  95.1  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  24.01 
 
 
802 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  23.27 
 
 
797 aa  94.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  21.79 
 
 
789 aa  93.6  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.38 
 
 
824 aa  93.6  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  24.01 
 
 
802 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  25.26 
 
 
784 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  25.08 
 
 
1305 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  23.77 
 
 
795 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  24.15 
 
 
811 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  25.42 
 
 
833 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  23.52 
 
 
797 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  24.09 
 
 
791 aa  93.2  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  22.46 
 
 
794 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  24.77 
 
 
792 aa  92.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  24.2 
 
 
795 aa  92.8  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  25.79 
 
 
800 aa  92  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  24.1 
 
 
797 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  24.58 
 
 
800 aa  91.3  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  24.38 
 
 
804 aa  91.3  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  23.55 
 
 
860 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  24.96 
 
 
798 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  23.84 
 
 
823 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  24.62 
 
 
848 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  23.63 
 
 
800 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  24.5 
 
 
797 aa  89  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  23.28 
 
 
793 aa  89.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  23.29 
 
 
837 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  22.15 
 
 
793 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  24.4 
 
 
783 aa  88.6  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  25.5 
 
 
811 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  22.03 
 
 
787 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  21.77 
 
 
794 aa  88.2  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  24.75 
 
 
797 aa  88.6  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  24.16 
 
 
789 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  24.91 
 
 
792 aa  88.2  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23 
 
 
810 aa  87.8  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  23.06 
 
 
823 aa  87.8  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4985  Phosphoketolase  26.98 
 
 
784 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  23.15 
 
 
791 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  23.15 
 
 
791 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  23.66 
 
 
811 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  24.25 
 
 
851 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  24.73 
 
 
832 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  23.98 
 
 
782 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  21.55 
 
 
788 aa  85.9  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  22.25 
 
 
818 aa  85.5  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  24.36 
 
 
828 aa  84.7  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  23.48 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  22.64 
 
 
813 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  22.55 
 
 
802 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  23.51 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  26.35 
 
 
802 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  23.83 
 
 
806 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  23.83 
 
 
806 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  23.98 
 
 
806 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  24.55 
 
 
784 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  22.46 
 
 
794 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  23.65 
 
 
790 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3248  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  24.9 
 
 
732 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.43 
 
 
832 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  24.03 
 
 
820 aa  81.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>