146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0187 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.08 
 
 
789 aa  803    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 
812 aa  1681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  54.47 
 
 
801 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.42 
 
 
790 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  52.69 
 
 
806 aa  798    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.34 
 
 
806 aa  818    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.98 
 
 
808 aa  903    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.86 
 
 
806 aa  918    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  51.93 
 
 
800 aa  774    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  55.36 
 
 
761 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.7 
 
 
792 aa  781    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.56 
 
 
815 aa  959    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  26.93 
 
 
782 aa  119  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  23.6 
 
 
780 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  25.04 
 
 
771 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  24.31 
 
 
851 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  23.19 
 
 
851 aa  98.2  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  25.13 
 
 
811 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  25.23 
 
 
800 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  24.39 
 
 
860 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.29 
 
 
835 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  23.66 
 
 
832 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  25.56 
 
 
1230 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  25.56 
 
 
1230 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  25 
 
 
1305 aa  94.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  24.47 
 
 
832 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  24.76 
 
 
1228 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  22.68 
 
 
791 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  22.68 
 
 
791 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  23.49 
 
 
793 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  24.13 
 
 
792 aa  91.3  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  23.41 
 
 
792 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  24.39 
 
 
833 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  24.89 
 
 
800 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  24.39 
 
 
811 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  24.03 
 
 
797 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  24.68 
 
 
793 aa  89  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  23.34 
 
 
795 aa  88.6  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3504  phosphoketolase  24.16 
 
 
772 aa  88.2  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705245  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  24.03 
 
 
820 aa  88.2  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  24.48 
 
 
798 aa  86.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  24.02 
 
 
805 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  23.46 
 
 
794 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  23.79 
 
 
811 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  23.97 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  24.42 
 
 
823 aa  83.2  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  22.06 
 
 
788 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  23.24 
 
 
787 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  24.86 
 
 
784 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  24.03 
 
 
811 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  23.57 
 
 
824 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  23.97 
 
 
813 aa  82  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1051  putative phosphoketolase  22.19 
 
 
788 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.414026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  23.67 
 
 
792 aa  81.6  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  23.83 
 
 
802 aa  81.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  22.78 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  22.28 
 
 
788 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.74 
 
 
828 aa  81.3  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  22.7 
 
 
813 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23.02 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  22.09 
 
 
788 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  22.74 
 
 
796 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  22.06 
 
 
788 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  23.4 
 
 
795 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  22.06 
 
 
788 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  24.48 
 
 
848 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  23.43 
 
 
796 aa  80.5  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  23.69 
 
 
825 aa  79.7  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  23.95 
 
 
782 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  21.65 
 
 
789 aa  78.2  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.22 
 
 
832 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  23.18 
 
 
793 aa  78.2  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  22.85 
 
 
811 aa  77.8  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  25.09 
 
 
783 aa  77.8  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  22.47 
 
 
788 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  21.8 
 
 
788 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  22.95 
 
 
791 aa  77.4  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  24.44 
 
 
812 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  24.77 
 
 
804 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  23.17 
 
 
806 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  21.8 
 
 
788 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  21.8 
 
 
788 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  23.17 
 
 
806 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  23.17 
 
 
806 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  23.83 
 
 
795 aa  77  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  23.8 
 
 
800 aa  76.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  22.95 
 
 
837 aa  76.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4985  Phosphoketolase  24.17 
 
 
784 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  22.82 
 
 
783 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  21.8 
 
 
792 aa  75.9  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  23.13 
 
 
794 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  23.3 
 
 
794 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  24.74 
 
 
823 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  23.09 
 
 
811 aa  75.1  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  22.29 
 
 
788 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  23.13 
 
 
797 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  23.35 
 
 
811 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  22.91 
 
 
802 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  21.46 
 
 
788 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  23.76 
 
 
802 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>