146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1285 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.62 
 
 		 815 aa  828    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.22 
 
 		 789 aa  801    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  51.93 
 
 		 812 aa  778    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  73.66 
 
 		 801 aa  1182    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  67.44 
 
 		 806 aa  1046    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  55.4 
 
 		 808 aa  820    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.76 
 
 		 806 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 		 800 aa  1624    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  74.51 
 
 		 761 aa  1149    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.49 
 
 		 792 aa  734    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.71 
 
 		 790 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  74.84 
 
 		 806 aa  1191    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  25.7 
 
 		 828 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  28.89 
 
 		 832 aa  118  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  28.46 
 
 		 782 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  25.42 
 
 		 811 aa  115  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  25.74 
 
 		 811 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  25.16 
 
 		 811 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  28.05 
 
 		 823 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  25.29 
 
 		 813 aa  110  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  25.19 
 
 		 810 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  24.18 
 
 		 780 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  26.01 
 
 		 771 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  24.79 
 
 		 802 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  25.99 
 
 		 797 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  24.08 
 
 		 788 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  25.61 
 
 		 798 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  23.48 
 
 		 788 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  23.21 
 
 		 788 aa  107  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  26.53 
 
 		 800 aa  107  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  24.33 
 
 		 851 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  26.2 
 
 		 784 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  22.22 
 
 		 794 aa  106  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  28.66 
 
 		 832 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  23.03 
 
 		 818 aa  106  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  26.12 
 
 		 789 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  25.99 
 
 		 800 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  25.26 
 
 		 795 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  26.78 
 
 		 791 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  27.05 
 
 		 795 aa  105  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  27 
 
 		 833 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  25.34 
 
 		 791 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  25.34 
 
 		 791 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  24.62 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  24.26 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  28.11 
 
 		 811 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  23.88 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  24.26 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  23.63 
 
 		 788 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  24.83 
 
 		 792 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  24.39 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  24.59 
 
 		 803 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  26.31 
 
 		 794 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  26.11 
 
 		 848 aa  102  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.91 
 
 		 831 aa  102  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  23.63 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  23.63 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  23.63 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  25.13 
 
 		 792 aa  101  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  24.23 
 
 		 792 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  25.82 
 
 		 835 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  23.32 
 
 		 793 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  25.43 
 
 		 837 aa  99.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  23.1 
 
 		 793 aa  99.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  25.26 
 
 		 825 aa  99.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  25.39 
 
 		 783 aa  99.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  26.41 
 
 		 820 aa  99  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  27.1 
 
 		 802 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  25.6 
 
 		 788 aa  98.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  23.53 
 
 		 817 aa  98.2  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  24.14 
 
 		 796 aa  98.2  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  24.23 
 
 		 790 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  26.45 
 
 		 795 aa  98.2  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  24.4 
 
 		 797 aa  97.8  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  25.24 
 
 		 794 aa  97.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  25.06 
 
 		 800 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  25.49 
 
 		 1230 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  22.86 
 
 		 788 aa  97.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  27.02 
 
 		 795 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  25.49 
 
 		 1230 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  25.84 
 
 		 812 aa  96.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  26.84 
 
 		 807 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  28.49 
 
 		 783 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  24.23 
 
 		 792 aa  95.9  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  25.66 
 
 		 797 aa  95.5  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  25.63 
 
 		 791 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3504  phosphoketolase  25.58 
 
 		 772 aa  95.1  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  26.16 
 
 		 804 aa  94.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  24.89 
 
 		 782 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  25.97 
 
 		 800 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  25.42 
 
 		 832 aa  94  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  25.82 
 
 		 811 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  23.83 
 
 		 834 aa  93.2  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  25.82 
 
 		 811 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  25.71 
 
 		 783 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  25.85 
 
 		 811 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  24.81 
 
 		 823 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  25.94 
 
 		 824 aa  91.7  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  24.91 
 
 		 806 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  24.85 
 
 		 797 aa  91.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>