149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1294 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2545  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  56.25 
 
 
815 aa  845    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3878  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  67.43 
 
 
789 aa  1056    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0187  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  52.37 
 
 
812 aa  790    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17580  hypothetical protein  54.94 
 
 
801 aa  793    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1294  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 
790 aa  1601    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3607  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  54.1 
 
 
806 aa  797    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  59.72 
 
 
808 aa  904    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  60.71 
 
 
806 aa  935    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1285  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  53.96 
 
 
800 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  55.16 
 
 
761 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3459  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  72.67 
 
 
792 aa  1124    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.165216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38520  phosphoketolase protein  54.73 
 
 
806 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  27 
 
 
782 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  25.94 
 
 
800 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  25.17 
 
 
800 aa  108  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  22.51 
 
 
788 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  24.97 
 
 
851 aa  104  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1046  putative phosphoketolase  22.28 
 
 
788 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00195546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  22.28 
 
 
788 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1147  putative phosphoketolase  22.28 
 
 
788 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  22.28 
 
 
788 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  24.6 
 
 
820 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  24.53 
 
 
795 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  24.87 
 
 
837 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  23.86 
 
 
860 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  23.69 
 
 
780 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.77 
 
 
824 aa  100  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  22.84 
 
 
788 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  24.02 
 
 
800 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  26.22 
 
 
811 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  24.49 
 
 
792 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1282  putative phosphoketolase  23.33 
 
 
788 aa  98.6  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0002253  normal  0.0247047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  25.14 
 
 
832 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  25.82 
 
 
797 aa  97.8  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  26.04 
 
 
811 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  22.53 
 
 
783 aa  97.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  24.67 
 
 
811 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  24.55 
 
 
833 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  23.09 
 
 
791 aa  96.3  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  23.09 
 
 
791 aa  96.3  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  23.96 
 
 
793 aa  96.3  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  24.36 
 
 
796 aa  96.3  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  24.22 
 
 
823 aa  95.5  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  22.71 
 
 
788 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0915  putative phosphoketolase  23.05 
 
 
788 aa  95.9  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0207514  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  24.44 
 
 
851 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  24.63 
 
 
802 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  24.04 
 
 
823 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  23.7 
 
 
791 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  24.34 
 
 
798 aa  95.1  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  22.71 
 
 
788 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  22.71 
 
 
788 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  24.26 
 
 
813 aa  94.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  22.1 
 
 
788 aa  94.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1051  putative phosphoketolase  21.45 
 
 
788 aa  94.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.414026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.79 
 
 
831 aa  94  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  21.79 
 
 
788 aa  93.6  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  22.72 
 
 
788 aa  94  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  24.88 
 
 
848 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.63 
 
 
835 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  23.99 
 
 
811 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  23.66 
 
 
832 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  24.14 
 
 
790 aa  92.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  25.68 
 
 
811 aa  92  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  22.75 
 
 
795 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  22.77 
 
 
793 aa  91.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  24.32 
 
 
789 aa  91.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  24.75 
 
 
788 aa  91.3  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  25.5 
 
 
794 aa  91.3  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  24.87 
 
 
771 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  25.87 
 
 
812 aa  90.9  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  22.63 
 
 
788 aa  90.9  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  24.66 
 
 
783 aa  90.9  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  24.7 
 
 
800 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  23.81 
 
 
811 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  23.05 
 
 
791 aa  90.5  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  23.85 
 
 
798 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  24.67 
 
 
832 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  22.92 
 
 
815 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  22.92 
 
 
815 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  23.83 
 
 
825 aa  87.4  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  23.6 
 
 
1305 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  22.57 
 
 
792 aa  85.1  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  23 
 
 
793 aa  85.1  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  23.79 
 
 
795 aa  85.1  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  23.9 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  23.27 
 
 
783 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  24.1 
 
 
810 aa  84.3  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  25.32 
 
 
792 aa  84  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  25.23 
 
 
789 aa  84  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  22.92 
 
 
817 aa  84  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.87 
 
 
828 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  24.91 
 
 
794 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  21.75 
 
 
796 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  24.74 
 
 
798 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  24.26 
 
 
802 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  24.29 
 
 
807 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  24.49 
 
 
782 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  24.14 
 
 
1230 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  23.49 
 
 
802 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>