More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3248 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_5099  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  75.79 
 
 
737 aa  1144    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0049  hypothetical protein  64.65 
 
 
745 aa  965    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0320211  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4264  transketolase, central region  77.47 
 
 
737 aa  1189    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0790452  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3603  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  87.41 
 
 
732 aa  1352    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4645  transketolase, central region  76.49 
 
 
736 aa  1150    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1364  Transketolase central region  62.76 
 
 
739 aa  914    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348759  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3248  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  100 
 
 
732 aa  1518    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1667  transketolase pyridine binding domain protein  63.59 
 
 
722 aa  898    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0802  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  73.11 
 
 
738 aa  1111    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2503  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  87.28 
 
 
732 aa  1351    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2034  Transketolase central region  66.07 
 
 
741 aa  972    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0295526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  23.88 
 
 
824 aa  108  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  23.28 
 
 
800 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  24.25 
 
 
810 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  24.13 
 
 
860 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  21.76 
 
 
831 aa  99  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  22.95 
 
 
832 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  22.29 
 
 
793 aa  98.2  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  22.6 
 
 
792 aa  97.8  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  23.98 
 
 
832 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  22.99 
 
 
833 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  22.24 
 
 
823 aa  95.1  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  22.66 
 
 
797 aa  94.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  23.53 
 
 
791 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  23.01 
 
 
790 aa  94  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.6 
 
 
835 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  25 
 
 
823 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  22.38 
 
 
795 aa  93.2  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  22.08 
 
 
825 aa  92.4  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  21.8 
 
 
789 aa  92.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  21.45 
 
 
792 aa  92  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.85 
 
 
828 aa  91.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  21.46 
 
 
795 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  20.64 
 
 
794 aa  91.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  22.93 
 
 
811 aa  91.3  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  22.18 
 
 
798 aa  90.9  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  21.48 
 
 
795 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  23.63 
 
 
782 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  22.4 
 
 
800 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  23.79 
 
 
792 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  24.17 
 
 
837 aa  90.5  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  23.16 
 
 
820 aa  89.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  23.09 
 
 
796 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  21.75 
 
 
791 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  22.18 
 
 
804 aa  88.6  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  21.03 
 
 
794 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  21.86 
 
 
783 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  22.17 
 
 
780 aa  87.4  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  22.98 
 
 
851 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  22.26 
 
 
793 aa  86.7  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  21.88 
 
 
811 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  23.18 
 
 
784 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  23.05 
 
 
797 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  22.09 
 
 
802 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  21.4 
 
 
811 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.49 
 
 
832 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  22.19 
 
 
796 aa  85.1  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  21.82 
 
 
811 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  21.88 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  21.72 
 
 
788 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  21.26 
 
 
795 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  22.58 
 
 
784 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  22.84 
 
 
797 aa  84  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  22.58 
 
 
798 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  22.53 
 
 
805 aa  83.2  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  23.3 
 
 
1230 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  22.11 
 
 
783 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  22.86 
 
 
818 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  22.19 
 
 
797 aa  83.2  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  22.29 
 
 
798 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  22.83 
 
 
1230 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  21.4 
 
 
789 aa  82  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  22.71 
 
 
812 aa  81.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  21.61 
 
 
800 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  23.48 
 
 
802 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  22.2 
 
 
791 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  22.2 
 
 
791 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  21.77 
 
 
793 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  22.27 
 
 
811 aa  80.9  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  23.03 
 
 
806 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  22.5 
 
 
793 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  21.84 
 
 
807 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  22.65 
 
 
1228 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  23.03 
 
 
806 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  23.03 
 
 
806 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  23.08 
 
 
811 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  23.08 
 
 
811 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  21.94 
 
 
783 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.19 
 
 
808 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  21.67 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  21.23 
 
 
788 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  22.19 
 
 
771 aa  77.8  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  22.43 
 
 
782 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  22.69 
 
 
820 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  23.24 
 
 
802 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  21.57 
 
 
788 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3243  putative phosphoketolase  21.7 
 
 
788 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  21.99 
 
 
788 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1113  putative phosphoketolase  21.86 
 
 
788 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0746473  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  22.62 
 
 
794 aa  76.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>