211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1364 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1364  Transketolase central region  100 
 
 		 739 aa  1528    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0049  hypothetical protein  63.16 
 
 		 745 aa  909    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0320211  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4264  transketolase, central region  64.58 
 
 		 737 aa  971    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0790452  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4645  transketolase, central region  62.5 
 
 		 736 aa  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0802  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.91 
 
 		 738 aa  947    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3248  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  62.76 
 
 		 732 aa  937    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2034  Transketolase central region  70.47 
 
 		 741 aa  1034    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0295526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2503  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  63.3 
 
 		 732 aa  941    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5099  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.99 
 
 		 737 aa  976    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3603  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  63.43 
 
 		 732 aa  940    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1667  transketolase pyridine binding domain protein  99.31 
 
 		 722 aa  1483    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.46 
 
 		 824 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23.22 
 
 		 810 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  22.43 
 
 		 825 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  23.29 
 
 		 820 aa  111  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  21.78 
 
 		 831 aa  106  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  23.5 
 
 		 798 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  22.35 
 
 		 823 aa  105  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  23.45 
 
 		 811 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  23.15 
 
 		 837 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  22.86 
 
 		 792 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.44 
 
 		 835 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  23.04 
 
 		 823 aa  101  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  22.05 
 
 		 828 aa  100  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  22.56 
 
 		 848 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  24.45 
 
 		 860 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  24.02 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  21.66 
 
 		 790 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  23.33 
 
 		 820 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  23.14 
 
 		 832 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  23.34 
 
 		 833 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  22.49 
 
 		 798 aa  97.4  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  23.52 
 
 		 823 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  22.67 
 
 		 800 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  22.09 
 
 		 791 aa  94.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  22.35 
 
 		 800 aa  94.7  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  23.2 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  22.43 
 
 		 791 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  22.43 
 
 		 791 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  23.05 
 
 		 800 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  24.58 
 
 		 851 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  22.01 
 
 		 789 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  22.87 
 
 		 811 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  23.81 
 
 		 811 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  23.35 
 
 		 795 aa  92  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  23.81 
 
 		 811 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  22.01 
 
 		 792 aa  91.3  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  23.67 
 
 		 805 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  22.29 
 
 		 811 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  22.37 
 
 		 783 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  23.48 
 
 		 812 aa  89.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  22.53 
 
 		 804 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  23.16 
 
 		 800 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  24.87 
 
 		 1228 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  22.58 
 
 		 795 aa  87.8  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  21.71 
 
 		 796 aa  87.4  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  24.1 
 
 		 782 aa  87.4  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  24.73 
 
 		 1230 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  23.39 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  23.39 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  22.62 
 
 		 806 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  24.73 
 
 		 1230 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  21.47 
 
 		 794 aa  87  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  23.55 
 
 		 832 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  22.67 
 
 		 811 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  23.71 
 
 		 802 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  22.34 
 
 		 811 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  21.59 
 
 		 821 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  22.3 
 
 		 794 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  25.29 
 
 		 832 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  21.88 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  22.69 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  21.22 
 
 		 793 aa  82.4  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  22.64 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  21.37 
 
 		 793 aa  81.6  0.00000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  24.6 
 
 		 791 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  21.32 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  21.45 
 
 		 798 aa  80.9  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  22.59 
 
 		 797 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  21.65 
 
 		 789 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  22.04 
 
 		 793 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  27.82 
 
 		 793 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  27.8 
 
 		 808 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  23.24 
 
 		 820 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  22.61 
 
 		 834 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  25.68 
 
 		 851 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  22.54 
 
 		 797 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  21.98 
 
 		 784 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  22.93 
 
 		 771 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  22.88 
 
 		 802 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  23.11 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  22.3 
 
 		 788 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  21.61 
 
 		 802 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  22.95 
 
 		 811 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  21.61 
 
 		 802 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  22.5 
 
 		 784 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  24.46 
 
 		 1305 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  21.97 
 
 		 802 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  23.01 
 
 		 815 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  22.56 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>