246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4264 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0049  hypothetical protein  65.89 
 
 
745 aa  972    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0320211  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4264  transketolase, central region  100 
 
 
737 aa  1517    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0790452  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2503  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  77.2 
 
 
732 aa  1186    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3248  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  77.47 
 
 
732 aa  1189    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1364  Transketolase central region  64.58 
 
 
739 aa  951    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348759  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1667  transketolase pyridine binding domain protein  65.41 
 
 
722 aa  937    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4645  transketolase, central region  79.94 
 
 
736 aa  1214    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5099  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  87.52 
 
 
737 aa  1339    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0802  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  80.19 
 
 
738 aa  1223    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2034  Transketolase central region  67.62 
 
 
741 aa  1008    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0295526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3603  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  77.2 
 
 
732 aa  1187    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.04 
 
 
824 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  24.18 
 
 
783 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  24.03 
 
 
789 aa  104  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  23.17 
 
 
792 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  24.28 
 
 
795 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  23.17 
 
 
788 aa  100  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  21.87 
 
 
823 aa  98.6  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  22.43 
 
 
795 aa  98.2  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  23.13 
 
 
800 aa  96.3  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  21.35 
 
 
831 aa  95.9  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  23.98 
 
 
833 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  23.13 
 
 
810 aa  95.9  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  22.38 
 
 
793 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  22.84 
 
 
811 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  23.84 
 
 
820 aa  94.4  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  23.37 
 
 
848 aa  94.4  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  22.79 
 
 
798 aa  94.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  22.89 
 
 
811 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  21.23 
 
 
790 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  23.8 
 
 
792 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  23.6 
 
 
837 aa  92.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  22.21 
 
 
794 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  23.67 
 
 
832 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  22.08 
 
 
795 aa  91.3  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  23.22 
 
 
804 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  24.48 
 
 
823 aa  90.9  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  21.78 
 
 
794 aa  90.9  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  23.31 
 
 
800 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  24.78 
 
 
782 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  23.55 
 
 
812 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  23.25 
 
 
784 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  23.53 
 
 
811 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  22.37 
 
 
783 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  24.64 
 
 
791 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  24.64 
 
 
791 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  23.3 
 
 
805 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  21.89 
 
 
791 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  23.02 
 
 
823 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  24.09 
 
 
860 aa  89  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  23.26 
 
 
792 aa  88.2  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  22.93 
 
 
796 aa  88.2  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  22.33 
 
 
797 aa  87.8  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  23.4 
 
 
802 aa  87.4  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  23.49 
 
 
802 aa  87.4  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  23.44 
 
 
791 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  23.46 
 
 
806 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  21.82 
 
 
811 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  23.46 
 
 
806 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  21.69 
 
 
793 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  23.32 
 
 
806 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  23.46 
 
 
792 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  23.61 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  23.49 
 
 
795 aa  85.1  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  22.36 
 
 
828 aa  84  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  22.67 
 
 
798 aa  84  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  22.31 
 
 
811 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.04 
 
 
835 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  23.7 
 
 
797 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  22.69 
 
 
798 aa  84  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  22.19 
 
 
790 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  21.71 
 
 
809 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  21.76 
 
 
797 aa  80.9  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  30.29 
 
 
832 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  22.35 
 
 
820 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  26.46 
 
 
851 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  23.27 
 
 
811 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  21.69 
 
 
780 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  23.66 
 
 
1230 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  24.94 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  23.11 
 
 
811 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  23.68 
 
 
1228 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  23.66 
 
 
1230 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  22.73 
 
 
820 aa  78.2  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  21.89 
 
 
800 aa  77.8  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  22.5 
 
 
796 aa  77.8  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  22.79 
 
 
825 aa  77  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  22.42 
 
 
802 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  24.27 
 
 
782 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  25.97 
 
 
784 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  26.05 
 
 
783 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.55 
 
 
832 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  22.17 
 
 
851 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  20.44 
 
 
793 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  23.03 
 
 
797 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  21.05 
 
 
807 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  31.1 
 
 
808 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  21.85 
 
 
788 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  22.87 
 
 
1305 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  22.88 
 
 
794 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>