223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0049 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_5099  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.78 
 
 		 737 aa  974    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2503  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.24 
 
 		 732 aa  971    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1529    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0320211  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4264  transketolase, central region  65.89 
 
 		 737 aa  991    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0790452  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2034  Transketolase central region  67.68 
 
 		 741 aa  988    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0295526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4645  transketolase, central region  62.57 
 
 		 736 aa  925    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3603  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.37 
 
 		 732 aa  975    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1667  transketolase pyridine binding domain protein  63.94 
 
 		 722 aa  885    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1364  Transketolase central region  63.16 
 
 		 739 aa  904    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0802  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  66.71 
 
 		 738 aa  986    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3248  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  64.65 
 
 		 732 aa  986    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  23.14 
 
 		 831 aa  110  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  28.21 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  23.69 
 
 		 825 aa  99.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  24.64 
 
 		 824 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  23.88 
 
 		 800 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  24.07 
 
 		 810 aa  91.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  24.71 
 
 		 792 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  23.66 
 
 		 783 aa  88.2  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  22.8 
 
 		 798 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  24.6 
 
 		 782 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  24.01 
 
 		 823 aa  85.9  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  22.95 
 
 		 795 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  22.17 
 
 		 793 aa  84.3  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  22.29 
 
 		 794 aa  84  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.4 
 
 		 828 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  23.71 
 
 		 823 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  23.15 
 
 		 860 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  23.11 
 
 		 851 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  24.46 
 
 		 832 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  24.1 
 
 		 811 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  22.8 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  22.56 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  23.5 
 
 		 800 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  23.81 
 
 		 802 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  24.24 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  21.87 
 
 		 798 aa  78.2  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  22.24 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  28.25 
 
 		 820 aa  77.4  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  22.84 
 
 		 771 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  23.57 
 
 		 789 aa  77  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  22.09 
 
 		 794 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  26.4 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  22.34 
 
 		 811 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  27.05 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  28.71 
 
 		 832 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  21.49 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  28.34 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  22.82 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  24.07 
 
 		 837 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  23.8 
 
 		 798 aa  75.1  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1497  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  28.22 
 
 		 808 aa  74.7  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  27.33 
 
 		 783 aa  74.7  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  27.51 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  25.85 
 
 		 788 aa  74.3  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  28.1 
 
 		 833 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  28.16 
 
 		 832 aa  73.9  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  27.27 
 
 		 783 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  22.16 
 
 		 800 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  23.22 
 
 		 791 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  23.22 
 
 		 791 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  23.03 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  22.6 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  26.47 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  22.63 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  27.85 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  22.38 
 
 		 802 aa  71.2  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  26.11 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  23.46 
 
 		 782 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  24.22 
 
 		 1228 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  24.39 
 
 		 1230 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  23.65 
 
 		 835 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  23.95 
 
 		 795 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  26.18 
 
 		 795 aa  70.5  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  24.39 
 
 		 1230 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  26.6 
 
 		 804 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  22.16 
 
 		 807 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  24.03 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  26.52 
 
 		 806 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  26.52 
 
 		 806 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2678  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  27.18 
 
 		 806 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.461204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  22.48 
 
 		 1305 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  23.5 
 
 		 811 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  23.31 
 
 		 794 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  24.21 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  22.29 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  28.2 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  26.38 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  22.81 
 
 		 820 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04913  phosphoketolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10760)  21.6 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  26.65 
 
 		 809 aa  67  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  27.39 
 
 		 811 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  25.6 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  28.23 
 
 		 797 aa  67.4  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  22.08 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  28.57 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  22.49 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  27.39 
 
 		 811 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1528  hypothetical protein  24.46 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  23.32 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>