156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1210 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  100 
 
 
324 aa  679    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  58.7 
 
 
327 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  43.57 
 
 
331 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  41.82 
 
 
338 aa  249  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  41.57 
 
 
346 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  42.06 
 
 
327 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  38.36 
 
 
365 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.27 
 
 
390 aa  212  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  37.96 
 
 
325 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.84 
 
 
411 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  31.25 
 
 
1020 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  34.04 
 
 
364 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  31.5 
 
 
370 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  33.14 
 
 
375 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  34.62 
 
 
377 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  34.91 
 
 
478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  33.42 
 
 
409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  34.91 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  29.86 
 
 
374 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  32.02 
 
 
380 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.89 
 
 
375 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  33.45 
 
 
370 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  29.61 
 
 
398 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  30.13 
 
 
1584 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  35.77 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  32.99 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  29.95 
 
 
370 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  33.85 
 
 
314 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.81 
 
 
342 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  30.36 
 
 
405 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  34.69 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  31.27 
 
 
358 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  31.69 
 
 
368 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  34.67 
 
 
390 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.62 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.62 
 
 
328 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  29.65 
 
 
365 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  28.93 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  29.52 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.64 
 
 
337 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  32.94 
 
 
367 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.93 
 
 
356 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  32.28 
 
 
367 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  31.76 
 
 
367 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  31.73 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  32.14 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  32.28 
 
 
367 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  32.64 
 
 
382 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  32.93 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  31.76 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  31.37 
 
 
367 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  31.37 
 
 
367 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  31.37 
 
 
367 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  32.24 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.59 
 
 
360 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  27.1 
 
 
411 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  29.66 
 
 
431 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  25.71 
 
 
712 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  28.09 
 
 
536 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  33.02 
 
 
365 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30 
 
 
450 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  27.52 
 
 
710 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  27.33 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.66 
 
 
607 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.21 
 
 
588 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.69 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  30.37 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.84 
 
 
420 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  27.36 
 
 
374 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  30.34 
 
 
372 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  31.05 
 
 
379 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  28.72 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.84 
 
 
383 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  29.63 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.15 
 
 
346 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  27.09 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  27.76 
 
 
395 aa  85.9  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.44 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.76 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  29.86 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.57 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.23 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.56 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  26.62 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.07 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  25.88 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.1 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.33 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.44 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  26.69 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.27 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  25.83 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  26.49 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.69 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.86 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  26.2 
 
 
672 aa  76.6  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3652  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.76 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103704  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  28.96 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.38 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  26.91 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>