138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3652 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3652  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  100 
 
 
380 aa  789    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103704  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  40.94 
 
 
388 aa  269  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  42.31 
 
 
369 aa  245  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  39.16 
 
 
378 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.58 
 
 
369 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  34.19 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.87 
 
 
607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  40.82 
 
 
420 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  36.39 
 
 
321 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  33.99 
 
 
384 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  35.08 
 
 
321 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2035  CapA family protein  34.92 
 
 
384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0211653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  34.74 
 
 
382 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.48 
 
 
348 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  31.07 
 
 
351 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  30.08 
 
 
340 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  30.34 
 
 
349 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  29.12 
 
 
536 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  29.76 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.34 
 
 
369 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.09 
 
 
342 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  28.09 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.47 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  29.66 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.79 
 
 
346 aa  90.1  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.16 
 
 
328 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  25.37 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.72 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  28.38 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.44 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  31.88 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  28.38 
 
 
367 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  28.38 
 
 
367 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  27.95 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  26.33 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.3 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  26.2 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  28.38 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  27.51 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  27.95 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  27.51 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  27.97 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  25.33 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  23.01 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.66 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.81 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.76 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3333  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.44 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.92 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.57 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  28.96 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  25.78 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.81 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  24.63 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  25.43 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  25.55 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  25 
 
 
710 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.16 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  27.13 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  24.5 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  26.45 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.44 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  24.35 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  25.08 
 
 
431 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  25.54 
 
 
1020 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  25.45 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  26.34 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.24 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.39 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.79 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  25.98 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.77 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  23.26 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  25.11 
 
 
362 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  25.08 
 
 
672 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  23.93 
 
 
450 aa  63.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  23.92 
 
 
396 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  56 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.85 
 
 
493 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  23.6 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  27.83 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  26.11 
 
 
1584 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  29.07 
 
 
491 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  29.39 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.13 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  23.08 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.55 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  23.67 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.97 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.47 
 
 
483 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  22.65 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.85 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  29.07 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  24.91 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.72 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  22.65 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  26.79 
 
 
466 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.93 
 
 
462 aa  59.7  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>