155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1784 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  100 
 
 
362 aa  750    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  48.05 
 
 
395 aa  281  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.62 
 
 
392 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  36.23 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  35.03 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  40.96 
 
 
397 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.54 
 
 
396 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  32.56 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  35 
 
 
330 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  37.45 
 
 
429 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  33.78 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  32.41 
 
 
404 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  33.02 
 
 
404 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  35.29 
 
 
411 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  35.66 
 
 
411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  34.97 
 
 
411 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.89 
 
 
440 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  32.48 
 
 
422 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  36.3 
 
 
418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  30.85 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  34.38 
 
 
483 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  35.16 
 
 
429 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  29.29 
 
 
388 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.93 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.39 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.45 
 
 
493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.63 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  28.85 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.03 
 
 
464 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.21 
 
 
466 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  29.92 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.37 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  29.39 
 
 
349 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  28.8 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  31.11 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.21 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  29.51 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  30.32 
 
 
358 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.02 
 
 
360 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.51 
 
 
450 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  30.37 
 
 
503 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  29.82 
 
 
536 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  28.47 
 
 
351 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.07 
 
 
328 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.73 
 
 
474 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.5 
 
 
356 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.14 
 
 
447 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  28.85 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.39 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.58 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  29.46 
 
 
367 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  28.64 
 
 
367 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  28.85 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.65 
 
 
462 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.79 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2038  hypothetical protein  25.65 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000700253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  28.12 
 
 
367 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.29 
 
 
314 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  28.52 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  29.5 
 
 
387 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  28.52 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  28.12 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  28.52 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  28.52 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.52 
 
 
440 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  27.89 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.25 
 
 
348 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  29.28 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  26.22 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.24 
 
 
360 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.46 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.3 
 
 
588 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  30.9 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  28.95 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  28.15 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  28.76 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  28.51 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.96 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.99 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.83 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  25.72 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.03 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  29.41 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  26.25 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1500  hypothetical protein  26.19 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  28.07 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  24.09 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  23.97 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  30.36 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.06 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  27.97 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  27.46 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  24.1 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  24.05 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  24.64 
 
 
710 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  22.83 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  27.12 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  25.27 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  26.27 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>