116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01300  capsule synthesis protein PGA_cap  100 
 
 
503 aa  1035    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1933  capsule biosynthesis protein CapA  32.11 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  normal  0.248941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3006  capsule biosynthesis protein CapA  32.72 
 
 
411 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3299  capsule biosynthesis protein CapA  32.11 
 
 
411 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2244  capA-related protein  31.2 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.06 
 
 
392 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  32.92 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  29.93 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1917  CapA domain-containing protein  28.28 
 
 
404 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.011599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1635  hypothetical protein  29.81 
 
 
404 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  30.71 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  32.19 
 
 
395 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1371  hypothetical protein  24.54 
 
 
392 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000119096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2278  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  28.43 
 
 
396 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  30.37 
 
 
362 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.09 
 
 
493 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.17 
 
 
403 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.34 
 
 
493 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.7 
 
 
429 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2458  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.34 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  32.71 
 
 
466 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.57 
 
 
483 aa  96.3  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  29.57 
 
 
379 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.36 
 
 
397 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  29.61 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.03 
 
 
418 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.49 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.83 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.79 
 
 
450 aa  87  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.96 
 
 
361 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0665  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.98 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0459157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0623  capsule biosynthesis protein  26.09 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0135845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1556  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.95 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0509053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2622  Capsule synthesis protein, CapA  26.47 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.24 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  30.37 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.74 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0657  poly-gamma-glutamic synthesis  25.85 
 
 
329 aa  77  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.801382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.81 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  30.16 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1536  Capsule synthesis protein, CapA  30.64 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.366141  normal  0.237354 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  23.66 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.79 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.03 
 
 
348 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.3 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  25.94 
 
 
367 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  23.79 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  24.04 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  29.59 
 
 
420 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1235  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.21 
 
 
455 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  24.23 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.72 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.72 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.72 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  24.35 
 
 
367 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  26.69 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  24.63 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4946  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.94 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0814916  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.48 
 
 
328 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.6 
 
 
360 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  26.12 
 
 
387 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  27 
 
 
373 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.57 
 
 
350 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.81 
 
 
314 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.39 
 
 
342 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1688  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.33 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  27.57 
 
 
536 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  26.97 
 
 
337 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  24.35 
 
 
373 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  25.47 
 
 
358 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  26.29 
 
 
420 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  26.98 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  23.63 
 
 
398 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  27 
 
 
327 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  22.49 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.68 
 
 
588 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  29.38 
 
 
395 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  27.5 
 
 
372 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  27.27 
 
 
372 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  22.41 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  25.91 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.88 
 
 
377 aa  54.7  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  23.05 
 
 
346 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  25.23 
 
 
356 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.14 
 
 
373 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  23.75 
 
 
375 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  22.37 
 
 
405 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  24.62 
 
 
365 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  27.07 
 
 
397 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  31.65 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.22 
 
 
368 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  25.47 
 
 
346 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  25.91 
 
 
380 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  22.06 
 
 
382 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  35.29 
 
 
390 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  23.6 
 
 
369 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  23.08 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1500  hypothetical protein  23.89 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  25.11 
 
 
431 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  22.03 
 
 
368 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>