142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10584 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  768    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  55.49 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  54.32 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  49.72 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  56.47 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  50.56 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  50.99 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  50.99 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  50.99 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  45.9 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  45.63 
 
 		 398 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  48.55 
 
 		 370 aa  318  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  46.69 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  48.63 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  48.21 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  46.59 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  45.83 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  43.84 
 
 		 382 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  37.77 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.08 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.15 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.02 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.7 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3091  poly-gamma-glutamate synthesis protein  51.64 
 
 		 120 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  31.91 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  34.02 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  34.64 
 
 		 327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.78 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.45 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.6 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  31.72 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  35.65 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  35.41 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  36.19 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.49 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  31.34 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.43 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  31.6 
 
 		 1584 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.11 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  31.38 
 
 		 1020 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.95 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  25.78 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.1 
 
 		 607 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.89 
 
 		 588 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.02 
 
 		 337 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.75 
 
 		 328 aa  86.3  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  24.05 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.64 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.71 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  33.62 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  28.34 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  32.35 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  25 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  25 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  31.65 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.65 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  33.61 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  25 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.25 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  22.14 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.03 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  24.17 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  26.48 
 
 		 536 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.5 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  25.66 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  27.35 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.73 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.58 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.96 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  30.23 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  22.09 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.42 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.42 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  24.28 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.43 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0698  Capsule synthesis protein, CapA  31.67 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  26.91 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.48 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.11 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  28.95 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3117  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  40.86 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  27.95 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.31 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.58 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  26.39 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  30.48 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  23.79 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  28.69 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1054  Capsule synthesis protein, CapA  27.49 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  24.8 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.13 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>