140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1691 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  100 
 
 
370 aa  758    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.95 
 
 
405 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.72 
 
 
398 aa  359  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  51.3 
 
 
409 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  51.59 
 
 
491 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  51.59 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  50.55 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  51.59 
 
 
377 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  49.72 
 
 
375 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  51.3 
 
 
370 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  50.83 
 
 
375 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  50.41 
 
 
374 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  52.46 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  53.04 
 
 
390 aa  338  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  50.14 
 
 
368 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  49.57 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  50.15 
 
 
370 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  48.55 
 
 
380 aa  318  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  36.18 
 
 
365 aa  183  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  36.73 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  44.58 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  34.07 
 
 
327 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  34.97 
 
 
390 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.5 
 
 
324 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  39.26 
 
 
338 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  35.96 
 
 
346 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  31.19 
 
 
365 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  40.49 
 
 
349 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  33.62 
 
 
358 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  35.54 
 
 
1584 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.51 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.29 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  36.67 
 
 
351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  37.44 
 
 
340 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.3 
 
 
411 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  32.33 
 
 
365 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.58 
 
 
360 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  34.5 
 
 
1020 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3091  poly-gamma-glutamate synthesis protein  43.64 
 
 
120 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.54 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  23.61 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  33.19 
 
 
314 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  23.93 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  26.42 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  24.66 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  31.78 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.36 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  30.81 
 
 
366 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  23.36 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  23.03 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  23.03 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  23.03 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  32.86 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  33.01 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  23.03 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  23.49 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.84 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.28 
 
 
588 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.3 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.64 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  30.33 
 
 
536 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.17 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
624 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.07 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.71 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.52 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  32.41 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.41 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.8 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  27.21 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.28 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.39 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  29.57 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  28.29 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  28.44 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  28.75 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  28.64 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.06 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  29.41 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  31.84 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  31.22 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  27.75 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.86 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  28.19 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  28.57 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  28.77 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.06 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  31.6 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  27.18 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  23.33 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1312  capA protein, putative  27.43 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  28.17 
 
 
851 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.47 
 
 
607 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.17 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  28.12 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  22.99 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  27.05 
 
 
1299 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2058  poly-gamma-glutamic synthesis PgsA protein-like  28.17 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1784  capsule biosynthesis protein CapA  27.57 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  25.12 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>