143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3851 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  100 
 
 		 379 aa  768    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  58.59 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  58.59 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  58.03 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  56.71 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.96 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.27 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  54.08 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  49.59 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  52.72 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  53.7 
 
 		 390 aa  358  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  50.55 
 
 		 370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  51.09 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  49.87 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  48.92 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  50.27 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  53.97 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  45.83 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  39.55 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.98 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  37.23 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  38.89 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.53 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.99 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  33.33 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  32.58 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  32.77 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3091  poly-gamma-glutamate synthesis protein  46.96 
 
 		 120 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  31.31 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  32.89 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  35.89 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.18 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.8 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  31.06 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.93 
 
 		 411 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  35.16 
 
 		 1584 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.66 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  32 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.04 
 
 		 588 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  35.37 
 
 		 1020 aa  90.5  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.42 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.42 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  25.11 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  23.66 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.83 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  23.78 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  30.97 
 
 		 536 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  23.65 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  23.65 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  23.31 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  22.97 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  22.97 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  22.97 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  22.97 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 624 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  30.22 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  25.96 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  29.73 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  29.44 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  32.24 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.58 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.58 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  24.81 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  32.88 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  31 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.09 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  26.69 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  29.85 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  35.21 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  29.57 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.49 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.34 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.09 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.97 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.73 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  26.42 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  29.13 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  26.89 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  29.35 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  31.33 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2688  hypothetical protein  24.56 
 
 		 712 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.09 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  27.91 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.24 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  29.22 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.67 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  29.63 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.13 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  26.84 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.07 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0806  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.86 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  24.47 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  26.72 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.78 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  21.89 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  23.96 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.86 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  32.29 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.67 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  23.6 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>