153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3480 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  100 
 
 
346 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  72.78 
 
 
338 aa  486  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.89 
 
 
365 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  50.3 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  46.22 
 
 
327 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  41.57 
 
 
324 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  41.61 
 
 
331 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  42.9 
 
 
327 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  38.69 
 
 
325 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.04 
 
 
398 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.73 
 
 
375 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  32.54 
 
 
349 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  35.96 
 
 
370 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  36.3 
 
 
1584 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  32.92 
 
 
1020 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.22 
 
 
348 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  34.46 
 
 
370 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  34.71 
 
 
375 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  32.7 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  31.73 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  34.02 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  34.19 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.26 
 
 
411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  32.77 
 
 
379 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  35.63 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  30.72 
 
 
358 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  33.1 
 
 
377 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  31.03 
 
 
370 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  33.73 
 
 
390 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  29.02 
 
 
411 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  32.11 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  32.04 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  32.11 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  33.12 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.53 
 
 
314 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.13 
 
 
328 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.91 
 
 
588 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  32.7 
 
 
536 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 
340 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  24.84 
 
 
367 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  24.53 
 
 
367 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  24.21 
 
 
367 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  24.21 
 
 
367 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  24.21 
 
 
367 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  24.53 
 
 
367 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  32.47 
 
 
382 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  23.9 
 
 
367 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  24.21 
 
 
367 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  28.75 
 
 
672 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25.64 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  24.68 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.58 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  28.09 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30 
 
 
420 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  29.37 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  24.18 
 
 
387 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.76 
 
 
368 aa  92.8  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  31.77 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  31.72 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.32 
 
 
360 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3206  CapA domain protein  23 
 
 
422 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  29.57 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.29 
 
 
379 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  30.15 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  31.8 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  28.3 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  30.49 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  26.38 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.65 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  28.35 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.87 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.05 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11420  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  26.22 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108091  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  26.23 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  22.57 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  28.51 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.33 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.6 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4972  Capsule synthesis protein, CapA  31.5 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.94 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  21.45 
 
 
607 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  25.66 
 
 
710 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.67 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.22 
 
 
493 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  25.77 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  27.99 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.71 
 
 
405 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11430  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  27.15 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.025004  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  25.95 
 
 
1299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  29.41 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  25.94 
 
 
851 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0638  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  24.35 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  25.62 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.18 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  26.64 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3300  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.17 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.58 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  25.54 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  25.97 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>