154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1734 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  100 
 
 
375 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  56.44 
 
 
405 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  53.39 
 
 
398 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  60.61 
 
 
390 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  55.89 
 
 
370 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  55.41 
 
 
491 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  55.95 
 
 
377 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  55.41 
 
 
409 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  52.57 
 
 
375 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  55.41 
 
 
478 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  55.77 
 
 
370 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  51.09 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  51.91 
 
 
374 aa  348  8e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  50.83 
 
 
370 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  50.95 
 
 
368 aa  342  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  53.63 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  54.31 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  48.21 
 
 
380 aa  309  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  39.23 
 
 
365 aa  192  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  38 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  35.56 
 
 
327 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.14 
 
 
324 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  35.45 
 
 
365 aa  149  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  36.59 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  34.71 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  34.85 
 
 
390 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.64 
 
 
411 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  33.92 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  38.16 
 
 
1020 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  31.39 
 
 
1584 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3091  poly-gamma-glutamate synthesis protein  49.14 
 
 
120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  33.82 
 
 
358 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  33.77 
 
 
365 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  23.39 
 
 
356 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  30.49 
 
 
349 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  26.55 
 
 
411 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  23.78 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  31.33 
 
 
340 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  35.29 
 
 
377 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  29.32 
 
 
536 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  23.63 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  33.63 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.68 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  23.61 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  23.29 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  26.44 
 
 
387 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  23.29 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  23.29 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  23.29 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  24.26 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  24.26 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  35.92 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  34.5 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  34.9 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  34.93 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  23.88 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  33.45 
 
 
325 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  27.41 
 
 
588 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  31.41 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  33.04 
 
 
431 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.1 
 
 
360 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14480  capsule synthesis protein PGA_cap  30 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  34.48 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  29.25 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  35.32 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.21 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.77 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  32.17 
 
 
374 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  34.42 
 
 
493 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0288  Capsule synthesis protein, CapA  33.04 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  34.42 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2312  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  27.14 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00411827  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  29.77 
 
 
672 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  30.29 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  30.48 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  30.13 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0060  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  35.35 
 
 
405 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  36.51 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.38 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1225  putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.23 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  25.68 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.23 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1939  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.19 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0513697  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.84 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.42 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0820  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.42 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1870  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  22.59 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3638  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  28.27 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0760  hypothetical protein  23.64 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718569  hitchhiker  2.13872e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2656  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  28.86 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
624 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  35.94 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  28.08 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  28.8 
 
 
851 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  26.32 
 
 
1299 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  25.32 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1489  hypothetical protein  25.41 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000816893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3259  hypothetical protein  24.62 
 
 
710 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962957  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  24.22 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>