157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3475 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3475  putative capsule biosynthesis protein  100 
 
 		 327 aa  656    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2950  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  55.52 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0483  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  47.76 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1210  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  42.06 
 
 		 324 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1511  Capsule synthesis protein, CapA  42.45 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3480  Capsule synthesis protein, CapA  43.21 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1059  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  42.33 
 
 		 390 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1691  CapA family protein  45.57 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0836  hypothetical protein  39.86 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.346342  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2565  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  38.44 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0504  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.55 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000299856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0506  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  37.97 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3669  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.14 
 
 		 375 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.573213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3775  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  37.5 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3851  putative capsule biosynthesis protein  38.89 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3529  capsule biosynthesis protein, putative  36.84 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.198641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2483  poly-gamma-glutamate synthesis protein  37.41 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.152076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3859  putative capsule biosynthesis protein  39.66 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.404083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1037  Mur ligase middle domain protein  35.24 
 
 		 1584 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1734  putative capsule biosynthesis protein  36.59 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720674  normal  0.681474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0036  capsule biosynthesis protein, putative  34.91 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0286  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.49 
 
 		 348 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000357505  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1318  polyglutamate synthase  35.76 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0617  poly-gamma-glutamate synthesis protein (capsule biosynthesis protein)  36.71 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3235  capsule biosynthesis protein, putative  34.32 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1460  hypothetical protein  34.93 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.900612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2407  Mur ligase middle domain-containing protein  35.37 
 
 		 1020 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.29011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1548  hypothetical protein  34.83 
 
 		 478 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0048  polyglutamate synthase  34.38 
 
 		 491 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46240  hypothetical protein  34.38 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.118841  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6138  putative capsule biosynthesis protein  34.27 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.608597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2523  poly-gamma-glutamate synthesis protein  36.81 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10584  hypothetical protein  34.64 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1464  hypothetical protein  36.49 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1192  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  33.21 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2406  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  31.88 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2389  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  35 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0615  capsule biosynthesis protein, putative  36.48 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.546592  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6169  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis enzyme  32.93 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0471744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1535  hypothetical protein  34.52 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1584  hypothetical protein  35.47 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.654532  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4101  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  26.73 
 
 		 588 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1681  SH3 type 3 domain protein  30.54 
 
 		 536 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1872  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  25 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000802014  normal  0.278856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3556  hypothetical protein  34.27 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1856  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1940  hypothetical protein  27.78 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2317  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.26 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1696  capsule biosynthesis protein  26.98 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1671  capsule biosynthesis protein  26.98 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1719  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1855  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1893  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3411  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  34.66 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1971  hypothetical protein  26.98 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1713  capsule biosynthesis protein CapA  28.17 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.680497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0519  hypothetical protein  29.62 
 
 		 366 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0064  capsule biosynthesis protein CapA  26.27 
 
 		 411 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1398  putative polyglutamate synthase CapA  29.71 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4801  capsule biosynthesis protein, putative  30.68 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2631  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.77 
 
 		 369 aa  99.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26970  predicted protein  33.33 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1651  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  32.39 
 
 		 368 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4800  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.64 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2843  Capsule synthesis protein, CapA  28.57 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2242  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  29.77 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2400  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  36.94 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7265  hypothetical protein  26.93 
 
 		 431 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2312  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  36.94 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0679  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  30.69 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0464077  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0169  CapA family protein  30 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0238  hypothetical protein  33.6 
 
 		 377 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14130  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  30.45 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0689518  normal  0.290388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2679  Mur ligase middle domain-containing protein  29.54 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1503  CapA family protein  31.06 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0138  Capsule synthesis protein, CapA  31.13 
 
 		 397 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2477  CapA family protein  28.73 
 
 		 388 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2260  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  35.27 
 
 		 474 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0234655  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2713  CapA family protein  31.06 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.292185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4320  hypothetical protein  31.09 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3661  poly-gamma-glutamate biosynthesis/capsule biosynthesis protein  29.25 
 
 		 672 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2329  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.66 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1991  CapA family protein  26.07 
 
 		 378 aa  85.9  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4760  hypothetical protein  31.2 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124071  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0324  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  24.61 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  normal  0.1082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1797  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.69 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0032  Capsule synthesis protein, CapA  29.3 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.563184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1951  hypothetical protein  30.26 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0958  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.63 
 
 		 607 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0278824  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4753  Mur ligase middle domain-containing protein  29.89 
 
 		 1299 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4665  Mur ligase, middle region  29.89 
 
 		 851 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0726  CapA domain protein  27.48 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000469143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0668  poly-gamma-glutamate biosynthesis protein  25.53 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.133268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1093  Putative protein of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  28.9 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1553  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like  34.68 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.561775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5041  hypothetical protein  25.93 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5412  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>